L'année 1506 est une année commune qui commence un jeudi. Le traité de Tordesillas (1493) a défini une zone réservée à la navigation portugaise et une zone réservée à la navigation castillane (limite : le méridien situé à 370 lieues à l'ouest des îles du Cap-Vert). Le royaume de Castille a une colonie dans les Caraïbes, Hispaniola (gouverneur : Nicolás de Ovando, « vice-roi des Indes ») ; les navigateurs espagnols poursuivent l'exploration de la région. Juan Díaz de Solís et Vicente Yañez Pinzon explorent la côte orientale du Yucatán. Fernand Soares, parti de Cochin en , découvre Madagascar. 6 mars : départ de Lisbonne d'une flotte portugaise dirigée par Tristan da Cunha et Albuquerque. 16 mars : à Cannanore, victoire navale de Lourenço de Almeida sur le zamorin de Calicut. 10 août : Ruy Pereira Coutinho, capitaine d'un des navires de la flotte de Tristan da Cunha en route vers les Indes, est contraint par le mauvais temps de jeter l'ancre dans un port de la côte occidentale de Madagascar auquel il donne le nom de Bahia Formosa. Novembre : la flotte de Tristan da Cunha atteint l'île de Mozambique où elle est empêchée de continuer sa route par la mousson. sd : Les Portugais pillent les comptoirs arabes de Oja et Brava, en Afrique orientale. sd : La Couronne de Portugal se réserve (au Portugal) le monopole du commerce de l'or et des épices. La Casa da India, héritière de la Casa da Guiné organise les conquêtes coloniales portugaises. sd : sd : Le roi d'Angleterre soutient les marchands de Bristol pour établir une « Compagnie des aventuriers dans les terres nouvelles ». 13 janvier : la mer gèle à Marseille. Hiver très rude dans le sud de la France. 14 janvier : au cours de fouilles de la Maison dorée de Néron, découverte du groupe du Laocoon. 18 avril : la première pierre de la basilique Saint-Pierre est posée par le pape Jules II. L'architecte italien Bramante en réalise les premiers plans. Le pape autorise la vente d’indulgences pour financer la construction. 10 mai : réunion des États généraux à Tours.