Feuillevignette|redresse=1.5|Feuille simple captant la lumière du soleil (cf. Colocasia) vignette|redresse=1.5|Tous les végétaux renferment des pigments photosynthétiques : chlorophylles (pigments verts), caroténoïdes (pigment orangés, bleus et rouges). Les pigments chlorophylliens, de loin les plus abondants, possèdent deux bandes d'absorption (bleu et rouge) dans le spectre lumineux, ce qui se traduit par une valeur maximale de la réflectance autour du vert, d'où la couleur verte des plantes grâce à la présence de lacunes aérifères dont les cavités d'air renvoient ce rayonnement dans toutes les directions.
Stroma (cytologie)vignette|Représentation simplifiée d'un chloroplaste situant le stroma, en jaune clair, entre la membrane interne du chloroplaste et la membrane des thylakoïdes. En cytologie, le stroma est le fluide incolore qui entoure les thylakoïdes dans les chloroplastes des cellules végétales. C'est en son sein que se déroule la fixation du carbone par le cycle de Calvin de la photosynthèse ainsi que la transcription et la traduction du plastome, c'est-à-dire du matériel génétique des chloroplastes, ces derniers possédant leurs propres ribosomes.
Phéophytinevignette|Structure de la phéophytine a. Une phéophytine est une chlorophylle dépourvue de son cation central de magnésium Mg2+. La est la plus commune, correspondant à la qui est le principal pigment photosynthétique, mais il existe également de la , chaque variété de chlorophylle ayant une phéophytine correspondante. Les phéophytines interviennent dans la photosynthèse comme premiers transporteurs d'électrons intermédiaires dans la chaîne de transfers d'électrons du photosystème chez les plantes , et du centre réactionnel photosynthétique des bactéries pourpres .
ChlorophyllideChlorophyllide a and Chlorophyllide b are the biosynthetic precursors of chlorophyll a and chlorophyll b respectively. Their propionic acid groups are converted to phytyl esters by the enzyme chlorophyll synthase in the final step of the pathway. Thus the main interest in these chemical compounds has been in the study of chlorophyll biosynthesis in plants, algae and cyanobacteria. Chlorophyllide a is also an intermediate in the biosynthesis of bacteriochlorophylls. Chlorophyllide a, is a carboxylic acid (R=H).
LithotrophLithotrophs are a diverse group of organisms using an inorganic substrate (usually of mineral origin) to obtain reducing equivalents for use in biosynthesis (e.g., carbon dioxide fixation) or energy conservation (i.e., ATP production) via aerobic or anaerobic respiration. While lithotrophs in the broader sense include photolithotrophs like plants, chemolithotrophs are exclusively microorganisms; no known macrofauna possesses the ability to use inorganic compounds as electron sources.
Complexe cytochrome b6fDISPLAYTITLE:Complexe cytochrome b6f Le complexe cytochrome b6f, ou complexe de cytochromes b6f, est une oxydoréductase qui catalyse la réaction : plastoquinol + 2 plastocyanines oxydées + 2 H+face 1 plastoquinone + 2 plastocyanines réduites + 2 H+face 2. Cette réaction est analogue à celle catalysée par la coenzyme Q-cytochrome c réductase de la chaîne respiratoire dans les mitochondries. Ce complexe enzymatique est présent dans la membrane des thylakoïdes, organites présents chez les cyanobactéries ainsi qu'à l'intérieur des chloroplastes, eux-mêmes organites photosynthétiques des algues vertes et des plantes.
Acide 3-phosphoglycériqueL’acide 3-phosphoglycérique — ou 3-phosphoglycérate sous forme déprotonée, abrégée en 3PG — est un composé organique important en biochimie. Seul l'énantiomère 3-phospho-D-glycérate est biologiquement actif. Il intervient selon les cas comme métabolite de la glycolyse en relation avec la chaîne respiratoire ou comme intermédiaire du cycle de Calvin en relation avec la photosynthèse.
AstaxanthineL'astaxanthine (dihydroxy-3,3 ́ dioxo-4,4 ́ β-carotène) est un pigment de la famille des xanthophylles (caroténoïdes), se présentant sous la forme d'un solide violacé de masse moléculaire . Présente naturellement dans certains crustacés, elle est utilisée comme colorant alimentaire. L'astaxanthine commerciale est extraite des sources suivantes (liste non exhaustive) : Euphausia pacifica (Krill pacifique); Euphausia superba (Krill antarctique); Haematococcus pluvialis (Microalgue); Pandalus borealis (Crevette arctique); Xanthophyllomyces dendrorhous, anciennement Phaffia rhodozyma (levure).
Photosystème ILe photosystème I (PSI) est une oxydoréductase qui catalyse la réaction : plastocyanine réduite + ferrédoxine oxydée + hν plastocyanine oxydée + ferrédoxine réduite. Ce complexe enzymatique est le second à intervenir dans les réactions de la photosynthèse dépendantes de la lumière. On le trouve dans la membrane des thylakoïdes chez les cyanobactéries et dans les chloroplastes des plantes et des algues. Le a été appelé ainsi car il a été découvert avant le , bien qu'il intervienne après celui-ci dans le fonctionnement de la photosynthèse.
Rayonnement photosynthétiquement actifLe rayonnement photosynthétiquement actif (RPA, ou PAR de l'anglais photosynthetically active radiation) est un rayonnement dont les longueurs d'onde s'étendent de 400 à 700 nm que les organismes photosynthétiques peuvent utiliser dans le processus de photosynthèse. L'énergie lumineuse reçue par la surface éclairée s'exprime en μmol.m-2.s-1 ou μE. Cette région spectrale correspond plus ou moins à la plage de lumière visible à l'œil humain.
