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Concept
Séquence homologue
Résumé
En biologie moléculaire, les séquences homologues sont deux ou plusieurs séquences nucléotidiques partageant une origine évolutive commune, c'est-à-dire présentant une homologie au sens de l'évolution moléculaire. Deux segments d'ADN distincts sont susceptibles d'avoir une origine commune à la suite d'une spéciation (orthologie), d'une duplication (paralogie) ou d'un transfert horizontal de gènes. L'homologie de l'ADN, de l'ARN et des protéines est généralement déduite de similitudes de la séquence des acides nucléiques ou des peptides traduits : de fortes similitudes entre séquences sont l'indication d'une origine commune. Les techniques d'alignement de séquences multiples permettent de préciser quelles régions de chaque séquence sont homologues.
redresse=3|centré|vignette| Alignement de séquences produit par à partir d'histones de mammifères. Les séquences représentées correspondent aux résidus d'acides aminés 120 à 180 de chacune de ces protéines. Les résidus conservés à travers toutes les séquences sont soulignés en gris. La ligne du bas indique le type de conservation observé : séquence conservée (*) ou mutation conservatrice (:), semi-conservatrice (.), ou non conservatrice ( ).
L'homologie de séquences est une notion distincte de leur degré d'identité ou de similitude. Ainsi, on parle parfois de « pourcentage d'homologie » pour signifier « similitude de séquence », en utilisant le pourcentage de résidus identiques (dit pourcentage d'identité) ou le pourcentage de conservation des propriétés physicochimiques des résidus (leucine et isoleucine par exemple, dit pourcentage de similitude) pour quantifier un « degré d'homologie entre séquences », ce qui est une terminologie erronée : si des séquences peuvent être plus ou moins semblables, elles sont en revanche ou bien homologues, ou bien non homologues, mais ne peuvent être partiellement homologues — elles peuvent en revanche être partiellement semblables. Plus précisément, on parlera d'homologie partielle lorsqu'une séquence présente des segments homologues qui ne s'étendent pas sur toute la longueur de la séquence, ce qui peut résulter d'une .
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