Afonso de Albuquerque (Alhandra 1453 - Goa, ) est un militaire, un navigateur, un explorateur et un homme politique portugais des . Il est gouverneur des Indes portugaises de 1509 à 1515 et une des grandes figures de l'expansion portugaise en Orient.
Deuxième fils de Gonçalo de Albuquerque, seigneur de , et de D. Leonor de Meneses, fille de D. Álvaro Gonçalves de Ataíde, comte d'Atouguia, il a été formé à la cour d'Alphonse V.
Le , il part pour l'Inde en faisant escale dans un port brésilien avec son cousin Francisco de Albuquerque, chacun commandant trois navires. Il participe à plusieurs batailles, construit une forteresse à Cochin et établit des relations commerciales avec Quilon (Coulão).
En 1506, il prend, pour le compte du Portugal, l'archipel de Socotra à l'entrée de la mer Rouge et, en , Ormuz à l'entrée du golfe Persique, verrouillant ainsi les voies maritimes arabes du long de la corne de l'Afrique.
À partir de 1508, successeur de Francisco de Almeida en tant que vice-roi des Indes, il est emprisonné par celui-ci qui refuse de rendre sa charge. Trois mois après, une flotte venue du Portugal libère Albuquerque. Il participe dès lors activement à l'expansion coloniale portugaise.
En novembre 1510, il prend Goa, la pille et en fait la capitale des possessions portugaises.
Le , les 18 ou 19 vaisseaux de guerre qu'il commande arrivent devant le port de Malacca. Le 25 juillet, après 3 semaines de siège, il lance l'assaut et prend une moitié de la ville. Deux semaines plus tard le reste de la ville tombait. Les Portugais pillent la ville pendant trois jours et s'emparent de d'or. Il permet aux Portugais de commercer avec le Siam, la Chine et les Moluques. Il permet ainsi de doubler la route de la soie par les voies maritimes portugaises, faisant du royaume du Portugal une grande puissance coloniale. Fernand de Magellan et Francisco Serrão figurent parmi les hommes de troupe qui participent à la bataille. L'aire commerciale portugaise tripla grâce à la prise de Malacca .