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In genetics, a locus (: loci) is a specific, fixed position on a chromosome where a particular gene or genetic marker is located. Each chromosome carries many genes, with each gene occupying a different position or locus; in humans, the total number of protein-coding genes in a complete haploid set of 23 chromosomes is estimated at 19,000–20,000. Genes may possess multiple variants known as alleles, and an allele may also be said to reside at a particular locus. Diploid and polyploid cells whose chromosomes have the same allele at a given locus are called homozygous with respect to that locus, while those that have different alleles at a given locus are called heterozygous. The ordered list of loci known for a particular genome is called a gene map. Gene mapping is the process of determining the specific locus or loci responsible for producing a particular phenotype or biological trait. Association mapping, also known as "linkage disequilibrium mapping", is a method of mapping quantitative trait loci (QTLs) that takes advantage of historic linkage disequilibrium to link phenotypes (observable characteristics) to genotypes (the genetic constitution of organisms), uncovering genetic associations. The shorter arm of a chromosome is termed the p arm or p-arm, while the longer arm is the q arm or q-arm. The chromosomal locus of a typical gene, for example, might be written 3p22.1, where: 3 = chromosome 3 p = p-arm 22 = region 2, band 2 (read as "two, two", not "twenty-two") 1 = sub-band 1 Thus the entire locus of the example above would be read as "three P two two point one". The cytogenetic bands are areas of the chromosome either rich in actively-transcribed DNA (euchromatin) or packaged DNA (heterochromatin). They appear differently upon staining (for example, euchromatin appears white and heterochromatin appears black on Giemsa staining). They are counted from the centromere out toward the telomeres. A range of loci is specified in a similar way. For example, the locus of gene OCA1 may be written "11q1.4-q2.

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The evolutionarily conserved Notch signaling cascade plays a pivotal role in the regulation of many fundamental processes such as stem cell maintenance, proliferation, and differentiation. Recently, we aimed to identify downstream target genes regulated by Notch1 during epidermal differentiation. For this purpose an Affymetrix mouse gene chip array of 14.000 genes was performed in both Notch1 gain and loss of function experiments using murine primary keratinocytes. Thirteen genes positively or negatively regulated, based on expression levels and relevance of the involved signaling pathways, were further validated by real-time PCR. Among these, we decided to focus on the Rho GTPase RhoV because it showed robust up- and down-regulation under both gain- and loss-of-function conditions. Therefore, we generated different transgenic mice expressing either a dominant active or a dominant negative form of RhoV specifically in the skin. Morphological and histological analyses did not reveal any overt skin phenotype in transgenic mice. In addition, challenging the system by performing wound healing assays demonstrated that the healing process in transgenic mice occurred normally and that the migration and/or differentiation of keratinocytes was unimpaired. Taken together, our data suggest that gain or loss of RhoV function does not perturb skin development and homeostasis, and does not affect the wound healing process. In addition to the investigation of the potential Notch target gene RhoV, we sought to generate both a floxed Jag2 gene targeted mouse line and a Notch2-specifc reporter mouse. The former was intended to enable conditional deletion of the Notch ligand Jagged2 and therefore allow its role to be studied in a loss-of-function context. The Notch2 reporter mouse is a tool enabling the in vivo study of cells that receive a Notch2-mediated signal. The strategy employs elements of a Tet-Off system and allows cells receiving a Notch2 specific signal to be identified in any tissue at any given time point.

EPFL2010

BIO-105: Cellular biology and biochemistry for engineers

Basic course in biochemistry as well as cellular and molecular biology for non-life science students enrolling at the Master or PhD thesis level from various engineering disciplines. It reviews essent

Locus

En génétique , un locus (pluriel « loci » ou « locus ») est une position fixe (d'un gène ou d'un marqueur génétique) sur un chromosome. Chaque chromosome porte de nombreux gènes. Une variante d'un gène situé à un locus donné est un allèle. Il ne faut pas confondre allèle et locus. Un allèle est une « version » d'un gène et peut se retrouver à différents endroits sur un même chromosome et même sur un chromosome différent (duplication et transposition).

Gène

Un gène, du grec ancien (« génération, naissance, origine »), est, en biologie, une séquence discrète et héritable de nucléotides dont l'expression affecte les caractères d'un organisme. L'ensemble des gènes et du matériel non codant d'un organisme constitue son génome. Un gène possède donc une position donnée dans le génome d'une espèce, on parle de locus génique. La séquence est généralement formée par des désoxyribonucléotides, et est donc une séquence d'ADN (par des ribonucléotides formant de l'ARN dans le cas de certains virus), au sein d'un chromosome.

Giemsa

NOTOC Le giemsa est un colorant spécifique des chromosomes, constitué d'un mélange de deux colorants (bleu de méthylène et éosine) rose violacé. Le giemsa permet notamment de mettre en évidence les territoires chromosomiques. (1867 – 1948) était à la fois chimiste et pharmacien. C'est dans les années 1900 qu'il développe la technique de coloration qui fut utile pour identifier dans les frottis sanguins le parasite de la malaria, Plasmodium falciparum.

Distance Génétique: Locus Interactions in Drosophila Melanogaster BIO-105: Cellular biology and biochemistry for engineers

Explore le calcul de distance génétique chez Drosophila melanogaster à travers des croisements dihybrides et des fréquences de recombinaison.

Géométrie analytique: locus de points dans un carré

Explore le lieu des points dans un carré et les angles entre eux.

Géométrie analytique: équations vectorielles des lignes

Couvre les équations vectorielles des lignes en géométrie analytique, y compris la recherche de points d'intersection et de projections orthogonales.