vignette|Juifs de Lituanie (1897) L'histoire des Juifs en Lituanie s'étend du à nos jours. Elle a été marquée par un très grand essor intellectuel aux sous l'impulsion du Gaon de Vilna et de ses disciples les Mitnagdim. Les Juifs de Lituanie étaient près de avant la Seconde Guerre mondiale. Ils ont presque entièrement disparu dans la Shoah. Seule une petite communauté d'environ subsiste à Vilnius et à Kaunas. Les premiers Juifs s'établissent à Vilna (aujourd'hui Vilnius) au et à Kovno (aujourd'hui Kaunas) au . Une communauté organisée existe à Vilna depuis le , comptant 10 000 à . C'est l'époque où l'approche dite lituanienne du judaïsme commence à se développer dans les yechivot de Lituanie. Jusqu'au , les communautés juives de Lituanie protégées par les grands-ducs de Lituanie puis les rois de Pologne, connaissent la paix et la prospérité, mais à partir de cette époque, les Juifs y subissent de multiples catastrophes malgré la protection des autorités lituaniennes ou polonaises. En 1635, une émeute détruit la toute nouvelle synagogue de Vilna et ses dix-huit rouleaux de la loi. De 1653 à 1663, diverses interdictions professionnelles sont édictées contre les Juifs. En 1654, Vilna est conquise par les Russes puis en 1655 par les Cosaques de Bohdan Khmelnytsky. Presque tous les Juifs sont tués et les survivants sont expulsés de Vilna. Les Juifs reviennent après le départ des Cosaques mais en 1708, Vilna est prise, cette fois par les Suédois et près de Juifs meurent du fait des combats et de la famine. En 1742, les Juifs de Vilna perdent tous les droits acquis sous le Grand-Duché de Lituanie ou la République des Deux Nations (Pologne-Lituanie). Le statut des Juifs s'améliore quelque peu lors du passage de la Lituanie sous la domination russe à la fin du pour à nouveau se dégrader durant le . Gaon de Vilna Eliyahou ben Shlomo Zalman, plus connu comme le Gaon de Vilna — le Génie de Vilna —, est l'un des représentants les plus éminents de la période des Aharonim (autorités juives des Temps modernes) et l'un des leaders juifs les plus influents de l'histoire moderne.