Une encéphalite est une inflammation non suppurative de l'encéphale (cerveau, tronc cérébral et/ou cervelet), généralement grave. Elle peut être d'origine infectieuse (bactérienne, parasitaire, mycosique, virale) ou immunologique (encéphalite auto-immune ou post infectieuse). Une encéphalite infectieuse est le plus souvent associée à une méningite, d'où le terme de méningoencéphalite. Quand l'ensemble du névraxe est touché, le terme d'encéphalomyélite est parfois utilisé. Une encéphalite qui ne touche que la substance grise est parfois appelée polioencéphalite, et que la substance blanche leucoencéphalite, et les deux panencéphalite. La prise en charge d'une suspicion d'encéphalite est une urgence hospitalière, axée sur la recherche d'une cause curable pouvant justifier un traitement probabiliste. Le terme encéphalite, signalé en 1806, a été popularisé en 1823 par Jean-Baptiste Bouillaud (1796-1881). Il se compose du suffixe -ite (inflammation) et d' « encéphale » apparu en français au à partir du grec egkephalos « cerveau ». Par convention, cette inflammation est non suppurative, ce qui exclut la méningite purulente et l'abcès cérébral. Le terme encéphalite se distingue du terme encéphalopathie qui se rapporte à diverses maladies de l'encéphale où l'inflammation ne prédomine pas : comme celles d'origine toxique ou métabolique, neurodégénérative anatomique ou vasculaire, atteintes par agent transmissible non conventionnel (maladies à prions). Pour l'ensemble des encéphalites (tous types confondus), l'incidence annuelle est estimée, selon les études, de ou de 5 à 8 cas pour cent mille habitants. Dans le Royaume Uni, on compte environ d'encéphalites (toutes causes confondues) par an, dans les années 2000, et aux États-Unis, près de par an dans les années 1980. Dans les pays développés, l'incidence des encéphalites infectieuses (hors VIH) est de l'ordre de pour cent mille habitants et par an, soit environ par an en France. Les causes sont variées. Elles restent inconnues dans près de la moitié des cas.
Francesco Stellacci, Paulo Henrique Jacob Silva