La Guerre du Péloponnèse, ou Histoire de la guerre du Péloponnèse (en grec ancien : Ἱστορία τοῦ Πελοποννησιακοῦ Πολέμου) est un ouvrage de l'historien athénien Thucydide écrit à la fin du et publié au début du siècle suivant, et qui raconte la guerre du Péloponnèse opposant la ligue du Péloponnèse, dirigée par Sparte, à la ligue de Délos, menée par Athènes ; il est généralement considéré comme la première œuvre constituant un récit historique fidèle et rigoureux.
L’œuvre relate en huit livres les vingt premières années de la guerre du Péloponnèse (431-411) et reste inachevée, probablement à cause de la mort de l'auteur vers 399. Trois continuations sont composées au pour poursuivre le récit de cette guerre jusqu'à la défaite d'Athènes en 404 : celles de Théopompe et de Cratippe ne nous sont pas parvenues, à l'inverse des deux premiers livres des Helléniques de Xénophon.
Thucydide est un général athénien qui a servi durant le conflit ; n'ayant pu empêcher la prise d'Amphipolis (424), il doit se résoudre à l'exil. Le texte a ainsi sans doute été écrit en majeure partie durant son exil même s'il semble en avoir eu le projet dès 431. Son projet est de transmettre aux générations suivantes un témoignage de ce qu'il pressent être un conflit majeur. Cette œuvre est très largement considérée comme un classique, « un chef-d'œuvre de compréhension historique ».
L'une des grandes nouveautés de l'analyse historique de Thucydide, c'est qu'il recherche la cause des événements. Son premier livre essaye d'exposer les causes directes et les causes profondes à l'origine du conflit.
Après une introduction présentant l'objet de l'ouvrage, s'ouvre une partie traditionnellement appelée l'« Archéologie » (§ 2-21) qui résume l'histoire grecque depuis les origines jusqu'au début des guerres médiques (490). Après quelques considérations méthodologiques puis générales (§22-23), Thucydide détaille les deux causes directes qui ont déclenché la guerre : l'affaire de Corcyre (435-433, § 24-55), qui voit cette cité indépendante passer dans le camp athénien à la suite de la guerre civile d'Épidamne ; et l'affaire de Potidée (432-429, § 56-66), colonie corinthienne membre de la Ligue de Délos, qui décide de faire défection et est assiégée par Athènes.