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Protein–protein interaction prediction

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De novo design of protein interactions with learned surface fingerprints

Systems and methods for de novo design of protein interactions with learned surface fingerprints

A new age in protein design empowered by deep learning

Impact of phylogeny on structural contact inference from protein sequence data

OccuVAE: Integrating unsupervised occupancy inference in data-driven energy modeling for human-centric operation

Statistical potentials from the Gaussian scaling behaviour of chain fragments buried within protein globules

Correlations from structure and phylogeny combine constructively in the inference of protein partners from sequences

Extracting phylogenetic dimensions of coevolution reveals hidden functional signals

Towards automating de novo protein design for novel functionalities: controlling protein folds and protein-protein interactions