L'anatomie du cheval, ou la description des parties internes de cet animal, a été étudiée tôt par l'homme, car ce dernier a cherché à comprendre son fonctionnement pour mieux l'utiliser. L'un des premiers ouvrages sur l'anatomie du cheval est celui de Carlo Ruini, en 1598. Le squelette est composé de 206 os et représente environ 8 % de la masse du cheval. Il supporte les parties molles du corps, joue le rôle de structure et protège les organes vitaux. La colonne vertébrale se compose de tandis que la boîte crânienne en possède 34. Le cheval a de côtes. Contrairement à l'homme, le cheval n'a pas de clavicule, un trait commun à la plupart des ongulés, dont les mouvements des membres antérieurs sont limités sur le côté. Le système squelettique est maintenu par des ligaments et des tendons. Les premiers relient les os entre eux tandis que les tendons assurent la liaison entre l'os et le muscle. Au niveau des articulations se trouvent les membranes synoviales qui contiennent le liquide synovial servant de lubrifiant naturel. Les autres parties de l'os sont entourées du périoste. La croissance du squelette du cheval se termine vers l'âge de six-sept ans approximativement, âge auquel les dernières vertèbres finissent leur croissance totale ; ce chiffre varie selon les individus, plus ou moins précoces. Le cheval possède cervicales, thoraciques ou vertèbres dorsales qui soutiennent les côtes ( de côtes, dont de côtes sternales et ou côtes libres, soit ), lombaires, sacrales, caudales/coccygiennes (de la queue). Les os du cheval sont classés en : os longs (humérus, péroné...) ; os courts (les vertèbres, les os du carpe et du tarse...) ; os plats (les os du bassin, l'omoplate...). Le cheval dispose de plus de 480 muscles ce qui représentent environ 60% de son poids. Les muscles sont constitués d'un ensemble de fibres. Ces fibres agissent par contraction ou par extension. Les muscles sont reliés aux os soit directement, soit par l'intermédiaire des tendons. Ils permettent le mouvement du cheval, en agissant sur le mouvement de la plupart des os entre eux.