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Biopython

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Graph Chatbot

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Posez n’importe quelle question sur les cours, conférences, exercices, recherches, actualités, etc. de l’EPFL ou essayez les exemples de questions ci-dessous.

AVERTISSEMENT : Le chatbot Graph n'est pas programmé pour fournir des réponses explicites ou catégoriques à vos questions. Il transforme plutôt vos questions en demandes API qui sont distribuées aux différents services informatiques officiellement administrés par l'EPFL. Son but est uniquement de collecter et de recommander des références pertinentes à des contenus que vous pouvez explorer pour vous aider à répondre à vos questions.

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BioRuby

BioRuby is a collection of open-source Ruby code, comprising classes for computational molecular biology and bioinformatics. It contains classes for DNA and protein sequence analysis, sequence alignment, biological database parsing, structural biology and other bioinformatics tasks. BioRuby is released under the GNU GPL version 2 or Ruby licence and is one of a number of Bio* projects, designed to reduce code duplication. In 2011, the BioRuby project introduced the Biogem software plugin system, with two or three new plugins added every month.

BioPerl

BioPerl is a collection of Perl modules that facilitate the development of Perl scripts for bioinformatics applications. It has played an integral role in the Human Genome Project. BioPerl is an active open source software project supported by the Open Bioinformatics Foundation. The first set of Perl codes of BioPerl was created by Tim Hubbard and Jong Bhak at MRC Centre Cambridge, where the first genome sequencing was carried out by Fred Sanger.

Alignement de séquences

En bio-informatique, l'alignement de séquences (ou alignement séquentiel) est une manière de représenter deux ou plusieurs séquences de macromolécules biologiques (ADN, ARN ou protéines) les unes sous les autres, de manière à en faire ressortir les régions homologues ou similaires. L'objectif de l'alignement est de disposer les composants (nucléotides ou acides aminés) pour identifier les zones de concordance. Ces alignements sont réalisés par des programmes informatiques dont l'objectif est de maximiser le nombre de coïncidences entre nucléotides ou acides aminés dans les différentes séquences.

Bio-informatique

La bioinformatique (ou bio-informatique), est un champ de recherche multidisciplinaire de la biotechnologie où travaillent de concert biologistes, médecins, informaticiens, mathématiciens, physiciens et bioinformaticiens, dans le but de résoudre un problème scientifique posé par la biologie. Plus généralement, la bio-informatique est l'application de la statistique et de l'informatique à la science biologique. Le spécialiste qui travaille à mi-chemin entre ces sciences et l'informatique est appelé bioinformaticien ou bionaute.