ARN-Targissement programmable et édition du génome

Cette séance de cours de l'instructeur couvre les principes de la biologie synthétique, en mettant l'accent sur le ciblage programmable des ARN et l'édition du génome à l'aide de la technologie CRISPR. Il s'inscrit dans l'histoire du CRISPR, de son système immunitaire adaptatif chez les procaryotes et des mécanismes du clivage CRISPR-Cas9. La séance de cours explore également les technologies d'ARN de précision, les stratégies d'édition de base et les applications des diagnostics basés sur le CRISPR, particulièrement dans le contexte du CoV-2 du SRAS. De plus, il traite de la méthodologie de ciblage programmable de l'ARN, des effecteurs d'ARN à base de protéines et du test de détection de SHERLOCK pour CoVID-19. La séance de cours se termine par un aperçu de l'importance du CRISPR-Cas9 dans l'ingénierie du génome et de ses diverses applications dans divers domaines.

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BIOENG-320: Synthetic biology

This advanced Bachelor/Master level course will cover fundamentals and approaches at the interface of biology, chemistry, engineering and computer science for diverse fields of synthetic biology. This

Édition génomique

alt=|vignette|295x295px|Schéma général du processus de modification localisée du génome. L'édition génomique ou modification localisée de séquence génomique (genome editing pour les anglophones) regroupe un ensemble de techniques de manipulation du génome visant à la modification du matériel (et donc de l'information) génétique. Ces techniques sont plus précises et ciblées que les techniques OGM historiques qui consistent à modifier ces organismes par transgenèse, procédé qui introduit un fragment d'ADN exogène à un emplacement aléatoire du génome.

Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats

vignette|368x368px|CRISPR/Cas9. thumb|500px|right|Diagramme du mécanisme de CRISPR. En génétique, les , plus fréquemment désignées sous le nom de CRISPR (acronyme prononcé ), sont des familles de séquences répétées dans l'ADN. De telles familles se caractérisent par des séries de répétitions directes courtes (de 21 à 37 paires de bases) et régulièrement espacées par des séquences appelées , généralement uniques, de 20 à 40 paires de bases.

Prokaryota

Un procaryote est un micro-organisme unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries). Les procaryotes actuels sont les bactéries et les archées. Les Prokaryota ne constituent pas un taxon valide du point de vue de la phylogénie. Dans la classification du vivant en sept règnes, les procaryotes formaient un taxon paraphylétique, regroupant ainsi des êtres vivants partageant une structure cellulaire similaire et simple.

Acide ribonucléique

vignette|Structure tridimensionnelle d'un ARN régulateur (riboswitch). vignette|Structure moléculaire de l'ARN. L'acide ribonucléique ou ARN (en anglais, RNA, pour ribonucleic acid) est un acide nucléique présent chez pratiquement tous les êtres vivants, et aussi chez certains virus. L'ARN est très proche chimiquement de l'ADN et il est d'ailleurs en général synthétisé dans les cellules à partir d'un segment d'ADN matrice dont il est une copie.

Cas9

thumb|236px|Une structure du Cas9 de S. aureus dans un complexe avec un ARN guide (haut) et son ADN cible (bas). Cas9 (en) est une protéine d'origine bactérienne aux propriétés anti-virales. Sa capacité à couper l'ADN au niveau de séquences spécifiques en a fait un outil de biologie moléculaire aux vastes perspectives d'utilisation. C'est une endonucléase d'ADN guidée par ARN, c'est-à-dire une enzyme spécialisée pour couper l'ADN avec deux zones de coupe actives, une pour chaque brin de la double hélice.

Outils et diagnostics fondés sur le CRISPR CH-412: Frontiers in chemical biology

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Diagnostics fondés sur le CRISPR CH-412: Frontiers in chemical biology

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Biophysique: Pliage des polymères et organisation de l'ADN

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Interrupteurs RNA: Conception et applications BIOENG-320: Synthetic biology

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