Intégration des ensembles de données en neurosciences avec MINDS

Description

Cette séance de cours couvre le processus de sélection du Blue Brain Nexus Project, le chargement de métadonnées provenant de diverses sources telles que la base de données de types Allen Cell et le projet MouseLight, la transformation des données pour les adapter au schéma Minimal Neuroscience Dataset (MINDS), leur intégration et leur versionnage dans le Blue Brain Nexus Project, et l'accès à l'ensemble de données. Les étudiants apprendront également comment transformer et intégrer les métadonnées des référentiels scientifiques dans le graphique de connaissances Blue Brain Nexus, et comment rechercher et télécharger des métadonnées par programme.

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Dans MOOCs (2)

Enseignant

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https://mediaspace.epfl.ch/media/0_emxszafa

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Concepts associés (4)

Métadonnée

Une métadonnée (mot composé du préfixe grec meta, indiquant l'auto-référence ; le mot signifie donc proprement « donnée de/à propos de donnée ») est une donnée servant à définir ou décrire une autre donnée, quel qu'en soit le support (papier, électronique ou autre). Un exemple type est d'associer à une donnée la date à laquelle elle a été produite ou enregistrée, ou à une photo les coordonnées géographiques du lieu où elle a été prise. Les métadonnées sont à la base des techniques du Web sémantique.

Registre de métadonnées

Un registre de métadonnées est, selon la définition qu’en donne le Dublin Core dans l’ébauche finale du , un « Système de gestion des métadonnées «, c’est-à-dire un système formel qui fournit l’information d’autorité sur la sémantique et la structure de chaque élément. Pour chaque élément, le registre en donne la définition, les qualificatifs qui lui sont associés, ainsi que les correspondances avec des équivalents dans d’autres langues ou d’autres schémas.

Standards et normes de métadonnées

Un standard ou une norme de métadonnées est une exigence qui est destinée à établir une compréhension commune de la signification ou de la sémantique des données, afin d'assurer un usage correct et approprié, et une interprétation des données par ses propriétaires et utilisateurs. Pour parvenir à cette compréhension commune, on doit définir un certain nombre de caractéristiques ou attributs des données, encore appelés métadonnées. En anglais, on utilise un seul mot, standard, pour décrire un standard ou une norme, ce qui est source de confusion.

Consolidation informatique

La consolidation est en informatique le regroupement cohérent de données. Elle concerne généralement des données organisées logiquement ou liées entre elles. Plus spécifiquement pour les tableurs, il s’agit du regroupement de plusieurs tableaux issus de feuilles différentes (les feuilles sont des composantes des tableurs) voire de classeurs différents. La consolidation de données consiste à rassembler plusieurs données semblables afin d’obtenir un rapport plus facile à consulter que l’information brute présente sur le serveur, avec le moins de perte d’information possible.