Séance de cours
Cette séance de cours présente le flux de travail ABBA, en mettant l'accent sur l'intégration des projets QuPath avec des images hébergées sur OMERO. L'instructeur explique comment importer un projet QuPath, exécuter l'algorithme DeepSlice pour la segmentation d'image et utiliser Elastix pour l'enregistrement d'image. Le processus aboutit à l'exportation des images traitées vers le projet QuPath. La séance de cours couvre les étapes nécessaires pour aligner et analyser les images du cerveau, en particulier en utilisant le cerveau de souris adulte de l'Atlas du cerveau Allen. L'instructeur souligne l'importance de techniques de traitement d'images précises dans la recherche biologique, en présentant les outils disponibles dans l'environnement BIOP Desktop. Le public acquiert un aperçu des applications pratiques de ces méthodes en neurosciences et en histologie, améliorant ainsi sa compréhension des flux de travail d’analyse d’images.