Interactions ARN-protéine: technologie PAR-CLIP

Cette séance de cours présente la technologie PAR-CLIP, en mettant l'accent sur la façon dont elle perturbe et sonde l'ARN/ADN cellulaire à l'aide d'outils de biologie chimique comme les sondes BrdU, EdU et Spinach. Il explique l'objectif biologique de l'étude des complexes ARN-protéines et de la lecture des séquences d'ARN. La séance de cours porte sur le processus des cellules de culture avec 4SU, le couplage croisé, l'immunoprécipitation et le séquençage pour identifier les sites de liaison à l'ARN. Il examine les avantages et les limites du PAR-CLIP, y compris sa précision dans la cartographie des interactions et les effets cytotoxiques potentiels. De plus, il explore d'autres applications de PAR-CLIP pour capter les interactions entre les ARNm et suivre les ARN cellulaires en utilisant des aptamères d'ARN comme imitateurs GFP.