Séance de cours
Cette séance de cours traite des défis et des limites dans le domaine de la protéomique, en mettant l'accent sur la complexité et la gamme dynamique de l'analyse des protéines. L'instructeur décrit les difficultés rencontrées lors de l'analyse des protéomes, qui génèrent un mélange très complexe de peptides après la digestion. Les limites des méthodes classiques d'acquisition dépendante des données (DDA) sont mises en évidence, y compris les problèmes de reproductibilité et les valeurs manquantes. La séance de cours présente le concept d'acquisition indépendante des données (DIA) comme une solution à ces défis, permettant une couverture plus complète des échantillons et des valeurs manquantes réduites. L'instructeur fournit des informations statistiques sur la couverture des protéomes, illustrant les compromis entre le temps d'analyse et le nombre de protéines identifiées. En outre, la séance de cours aborde les complexités de la quantification et de l'étude des modifications post-traductionnelles (PTM), en soulignant la nature dynamique de ces modifications et les défis actuels pour comprendre pleinement leur pertinence fonctionnelle. Dans l’ensemble, la séance de cours fournit un aperçu complet de l’état actuel et des orientations futures de la recherche en protéomique.