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Antonio Carlos Alves Meireles Filho

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Publications associées (12)

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BRB-seq: ultra-affordable high-throughput transcriptomics enabled by bulk RNA barcoding and sequencing

Bart Deplancke, David Hacker, Bastien Mangeat, Vincent Roland Julien Gardeux, Julie Marie Russeil, Daniel Alpern, Antonio Carlos Alves Meireles Filho

Despite its widespread use, RNA-seq is still too laborious and expensive to replace RT-qPCR as the default gene expression analysis method. We present a novel approach, BRB-seq, which uses early multiplexing to produce 3 cDNA libraries for dozens of sample ...

2019

A parallelized, automated platform enabling individual or sequential ChIP of histone marks and transcription factors

Bart Deplancke, Vincent Roland Julien Gardeux, Riccardo Dainese, Jia Yuan Jiang, Daniel Alpern, Antonio Carlos Alves Meireles Filho, Gerard Llimos Aubach

Despite its popularity, chromatin immunoprecipitation followed by sequencing (ChIP-seq) remains a tedious (>2 d), manually intensive, low-sensitivity and low-throughput approach. Here, we combine principles of microengineering, surface chemistry, and molec ...

National Academy of Sciences2020

Extensive tissue-specific expression variation and novel regulators underlying circadian behavior

Matteo Dal Peraro, Bart Deplancke, Vincent Roland Julien Gardeux, Julie Marie Russeil, Virginie Sandra Braman, Antonio Carlos Alves Meireles Filho, Maria Litovchenko, Michael Vincent Frochaux, Alessio Prunotto, Brian Dennis Hollis

Natural genetic variation affects circadian rhythms across the evolutionary tree, but the underlying molecular mechanisms are poorly understood. We investigated population-level, molecular circadian clock variation by generating >700 tissue-specific transc ...

2021