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Tuure Eelis Hameri

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Publications associées (5)

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The effects of model complexity and size on metabolic flux distribution and control: case study in Escherichia coli

Vassily Hatzimanikatis, Georgios Fengos, Tuure Eelis Hameri

Background Significant efforts have been made in building large-scale kinetic models of cellular metabolism in the past two decades. However, most kinetic models published to date, remain focused around central carbon pathways or are built around ad hoc re ...

BMC2021

Constraint-based metabolic control analysis for rational strain engineering

Vassily Hatzimanikatis, Ljubisa Miskovic, Meriç Ataman, Tuure Eelis Hameri, Sofia Tsouka

The advancements in genome editing techniques over the past years have rekindled interest in rational metabolic engineering strategies. While Metabolic Control Analysis (MCA) is a well-established method for quantifying the effects of metabolic engineering ...

2021

Statistical inference in ensemble modeling of cellular metabolism

Vassily Hatzimanikatis, Marc-Olivier Boldi, Tuure Eelis Hameri

Kinetic models of metabolism can be constructed to predict cellular regulation and devise metabolic engineering strategies, and various promising computational workflows have been developed in recent years for this. Due to the uncertainty in the kinetic pa ...

2019