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Asli Sahin

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Unités associées (1)

Laboratoire de biotechnologie computationnelle des systèmes

EPFL
SB
ISIC
LCSB

Publications associées (3)

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Optimality principles for the analysis of biological processes across scales: From enzyme kinetics to microbiome dynamics

Asli Sahin

Microorganisms are essential for life on Earth, performing key roles in numerous biological processes. Their influence extends across a wide spectrum, from human health and ecological balance to advancements in biotechnology and industrial applications. Th ...

EPFL2024

Optimal enzyme utilization suggests that concentrations and thermodynamics determine binding mechanisms and enzyme saturations

Vassily Hatzimanikatis, Daniel Robert Weilandt, Asli Sahin

One of the main challenges hampering the development of kinetic models is the lack of kinetic parameters for many enzymatic reactions. Here, the authors introduce a framework to explore the catalytically optimal operating conditions of any complex enzyme m ...

Nature Portfolio2023

From microbiome composition to functional engineering, one step at a time

Vassily Hatzimanikatis, Asli Sahin, Mohammadomid Oftadeh, Evangelia Vagena

Communities of microorganisms (microbiota) are present in all habitats on Earth and are relevant for agriculture, health, and climate. Deciphering the mechanisms that determine microbiota dynamics and functioning within the context of their respective envi ...

Amer Soc Microbiology2023