Publication

Aging Fly Cell Atlas identifies exhaustive aging features at cellular resolution

Maria Brbic, Sandy Lee
2023
Article
Résumé

Aging is characterized by a decline in tissue function, but the underlying changes at cellular resolution across the organism remain unclear. Here, we present the Aging Fly Cell Atlas, a single-nucleus transcriptomic map of the whole aging Drosophila. We characterized 163 distinct cell types and performed an in-depth analysis of changes in tissue cell composition, gene expression, and cell identities. We further developed aging clock models to predict fly age and show that ribosomal gene expression is a conserved predictive factor for age. Combining all aging features, we find distinctive cell type-specific aging patterns. This atlas provides a valuable resource for studying fundamental principles of aging in complex organisms.

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Concepts associés (32)
Expression génétique
L'expression des gènes, encore appelée expression génique ou expression génétique, désigne l'ensemble des processus biochimiques par lesquels l'information héréditaire stockée dans un gène est lue pour aboutir à la fabrication de molécules qui auront un rôle actif dans le fonctionnement cellulaire, comme les protéines ou les ARN. Même si toutes les cellules d'un organisme partagent le même génome, certains gènes ne sont exprimés que dans certaines cellules, à certaines périodes de la vie de l'organisme ou sous certaines conditions.
Régulation de l'expression des gènes
La régulation de l'expression des gènes désigne l'ensemble de mécanismes mis en œuvre pour passer de l'information génétique incluse dans une séquence d'ADN à un produit de gène fonctionnel (ARN ou protéine). Elle a pour effet de moduler, d'augmenter ou de diminuer la quantité des produits de l'expression des gènes (ARN, protéines). Toutes les étapes allant de la séquence d'ADN au produit final peuvent être régulées, que ce soit la transcription, la maturation des ARNm, la traduction des ARNm ou la stabilité des ARNm et protéines.
Vieillissement
Le vieillissement est l'ensemble des modifications fonctionnelles diminuant progressivement l'aptitude d'un objet, d'une information ou d'un organisme à assurer ses fonctions dans le temps. Dans le cas d'un organisme vivant (être humain par exemple), la plupart des cellules et organes ont une durée de vie maximale génétiquement programmée, mais ce processus peut être accéléré par divers stress subis in utero ou durant la vie - qui conduisent le plus souvent cet organisme à ne plus assurer son équilibre physiologique, ce qui le mène à la mort.
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2022

Symbolic kinetic models in python (SKiMpy): intuitive modeling of large-scale biological kinetic models

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OXFORD UNIV PRESS2022
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