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Le groupe Weigert de l'EPFL se concentre sur les approches d'apprentissage automatique à base d'images pour extraire des informations biologiques quantitatives à partir d'images en microscopie. Ils développent de nouvelles méthodes de vision informatique adaptées aux questions biologiques, y compris la détection et la segmentation des objets, la microscopie informatique et l'apprentissage autosupervisé. Leur travail récent comprend l'élaboration d'une méthode de segmentation des noyaux d'apprentissage profond pour les images d'histopathologie et d'une méthode de préformation auto-supervisée pour les vidéos de microscopie de cellules vivantes. En collaboration avec d'autres groupes, ils ont créé des méthodes de segmentation pour extraire la forme et l'emplacement des organites cellulaires à l'intérieur des cellules bêta pancréatiques à partir d'images de microscopie électronique.