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SARS-CoV-2 epidemiological model based on socio economic variables in Switzerland

Résumé

Existing epidemiological models analyze the transmission of infectious diseases considering a perfect homogenous population. However, the COVID-19 emergency has shown the importance of considering activity-travel behavior when studying the spreading of the virus. With increasing epidemiological data available, and the outburst on agent-based activity models, we can move beyond aggregation and start including individual features. To the best of the authors knowledge, this is the most in-depth study of how socio-economic and virological features impact the spreading of COVID-19 to date. We use chronological data from the Federal Office of Public Health (FOPH) from mid-February 2020 to midSeptember 2021. We derive the influence of socio-economic characteristics with a novel semidisaggregated SIRD model, obtaining the total number of infections per specific group of the population sharing pre-determined features. Finally, we validate our model with Google data and compute the reinfection rate by applying non-pharmaceutical interventions. Five features, including information about the individual and the municipality, have a ≥ 95% probability of being correlated with the endogenous variable of positive testing for COVID19. In addition, we find that certain variables, including age or the population density per square meter, remain representative for all waves, whereas others, like household income, are dependent on the epidemiological wave studied. Our results suggest a strong dependency on individual and municipality characteristics and the force of infection of COVID-19.

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Concepts associés (36)
SARS-CoV-2
Le SARS-CoV-2 (acronyme anglais de severe acute respiratory syndrome ), soit du syndrome respiratoire aigu sévère, est le virus responsable de la Covid-19. Son acronyme est parfois partiellement francisé en SRAS-CoV-2. Ce coronavirus hautement pathogène a été découvert en dans la ville de Wuhan (province de Hubei, en Chine). Le SARS-CoV-2 est un virus à ARN monocaténaire de polarité positive du groupe de la classification Baltimore. C'est une souche nouvelle de l'espèce SARSr-CoV, dans le genre betacoronavirus qui regroupe entre autres les SARS-CoV-1 et MERS-CoV.
Santé publique
right|thumb|From FLIES and FILTHto FOOD and FEVER En français : Des MOUCHES et de la SALETÉà la NOURRITURE et à la FIÈVRE Affiche publiée par le State Board of Health (Commission d'État sur la Santé) de la Floride en 1916. La santé publique peut être définie comme , ou encore comme des . Cette définition s'entend sur la population humaine. Une nouvelle conception "one health", "une seule santé", qui s'applique à l'ensemble des populations animales, végétales et leurs interconnexions complexes avec l'environnement, émerge depuis les années 2000 et permet une approche plus globale de la santé notamment publique.
Test diagnostique du SARS-CoV-2
Un test diagnostique du SARS-CoV-2 peut être effectué en cas de suspicion de maladie à coronavirus 2019 (Covid-19) à l'examen clinique et en complément à des examens approfondis (tomodensitométrie, etc.). Il peut être effectué par des tests de réaction en chaîne par polymérase après transcriptase inverse pour la détection de l'ARN viral (RT-PCR, pour « reverse transcription - polymerase chain reaction ») ou par des tests à base d'anticorps ELISA pour la détection des protéines du virion.
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