Oryza sativaOryza sativa, le riz asiatique, est une espèce de plantes monocotylédones de la famille des Poaceae, sous-famille des Oryzoideae, originaire des régions tropicales d'Asie. Cette espèce, domestiquée il y a environ , est avec le riz africain (Oryza glaberrima) l'une des deux espèces cultivées du genre Oryza qui compte 19 espèces acceptées. Elle compte des milliers de cultivars généralement groupés en deux sous-espèces, ou groupes de cultivars ,Oryza sativa subsp. indica et Oryza sativa subsp. japonica.
Rhizoctone brunLe rhizoctone brun, appelé aussi « rhizoctone noir », « variole des tubercules » ou « maladie des manchettes », est une maladie cryptogamique qui affecte notamment diverses plantes cultivées dont la betterave, la pomme de terre, ainsi que carotte, chicorée, laitue, endive... et qui est causée par un champignon basidiomycète, Rhizoctonia solani Kühn. thumb|left|Betterave à sucre atteinte. Ce champignon à distribution cosmopolite, dont la téléomorphe est Thanatephorus cucumeris, a une vaste gamme de plantes-hôtes.
Pseudomonas syringaePseudomonas syringae (Pseudomonas syringae syringae, TAX: 208964) est une bactérie du genre Pseudomonas qui est un complexe comptant plus de 60 espèces en bâtonnet, toutes à Gram négatif et munies de flagelles polaires, capables de se multiplier sur des milieux variés. Certaines souches de Pseudomonas sont symbiotes de plantes et de la microflore du sol, mais dans certaines conditions, certains Pseudomonas sont des pathogènes mortels pour l'animal et l'Homme, ce qui explique qu'une partie des données sur P.
Medicago truncatulaMedicago truncatula, la luzerne tronquée, est une espèce de plantes dicotylédones de la famille des Fabaceae, sous-famille des Faboideae, originaire du bassin méditerranéen. Ce sont des plantes herbacées annuelles, proches de la luzerne cultivée, pouvant atteindre 40 cm de haut. La luzerne tronquée est parfois cultivée comme plante fourragère et il en existe de nombreux cultivars. Cette espèce a été identifiée comme la plante modèle des Fabaceae puisque ces dernières présentent la capacité de former des nodosités racinaires capables de fixer l'azote atmosphérique.
Nodositévignette|Schéma simplifié représentant l'interaction mutualiste entre la plante et les bactéries symbiotiques () dans les . vignette|Nodosités sur racines de soja. Les nodosités ou nodules sont des modifications des poils absorbants des racines, que certaines plantes développent pour améliorer leur nutrition d'azote sous l'action de certaines bactéries. Ces bactériocécidies se forment, sous l'action de bactéries symbiotiques fixatrices de l'azote atmosphérique, essentiellement sur les racines de nombreuses espèces de plantes (Fabacées appelées aussi Légumineuses, Ulmacées, Bétulacées, Casuarinacées, Eleagnacées, Myricacées, Rosacées, etc.
Phytoplasmevignette|Jaunissement mortel du palmier. Les phytoplasmes sont des bactéries sans paroi et dépourvues de forme spécifique (procaryotes pléiomorphes) qui se multiplient exclusivement dans les tubes criblés du phloème. Ils appartiennent à la classe des Mollicutes. À leur découverte ils ont été nommés MLO (sigle de Mycoplasma Like Organism) en raison de leur ressemblance (en microscopie électronique) avec les mycoplasmes. Ils sont à l’origine de nombreuses maladies bactériennes des plantes telles que la phyllodie par exemple.
PyrrhotiteLa pyrrhotite est une espèce minérale composée de sulfure de fer, de formule Fe1-xS, 0 < x < 0,20, à structure type nickéline, dureté 31⁄2-41⁄2, de couleur jaune–bronze, noircissant à l'air. La pyrrhotite cristallise en lamelles {001}. Décrit par Johann August Friedrich Breithaupt en 1835. Du grec "PYRROTHES" = roux, en référence à sa couleur. Mine de Chichibu, Akaïwa, Japon dipyrite (Readwin) hépatopyrite magnétopyrite pyrrhotine Cobaltoan Pyrrhotite : Variété cobaltifère de la pyrrhotite, connue à Elbrus caldera, Elbrus, Nord-Est de la région du Caucase, Russie.
Traitement des semencesvignette|Graines ayant subi un traitement fongicide avant semis, traitement qui peut ensuite fortement nuire à la mycorhyzation de la plante. vignette|Les graines de canola (colza) de couleurs différentes mélangées. En agriculture et horticulture, le traitement des semences est la préparation des graines destinées aux semis, notamment au moyen de pesticides les protégeant des germes pathogènes et des parasites animaux. Les adjuvants tels que les pelliculants et les enrobants permettent de faciliter les semis et d'améliorer l'efficacité des traitements.
Sélection assistée par marqueursLa sélection assistée par marqueurs est une méthode de sélection des animaux d'élevage ou des végétaux qui s'appuie sur la recherche de marqueurs moléculaires associés à des gènes d’intérêts. Elle consiste à repérer des marqueurs dont la présence chez un individu peut être associé à la présence d'un gène (fort déséquilibre de liaison). Ces gènes permettent ensuite de faciliter la pratique des rétrocroisements, de mieux connaître le potentiel génétique de l'individu (prédit par exemple par un modèle de sélection génomique) ou encore de mieux prédire le résultat d'un croisement.
Corridor biologiqueL’expression corridor biologique (ou « biocorridor ») ou corridor écologique désigne un ou des milieux reliant fonctionnellement entre eux différents habitats vitaux pour une espèce, une population, une métapopulation ou un groupe d’espèces ou métacommunauté (habitats). Ces unités qui tranchent dans l'espace environnant en raison de leur configuration linéaire relativement étroite, de caractère végétal (haies, chemins et bords de chemins, ripisylves...), topographique (vallon, cours d’eau...
