Génomique

La génomique est une discipline de la biologie moderne. Elle étudie le fonctionnement d'un organisme, d'un organe, d'un cancer, etc. à l'échelle du génome, au lieu de se limiter à l'échelle d'un seul gène. La génomique se divise en deux branches : La génomique structurale, qui se charge du séquençage du génome entier ; La génomique fonctionnelle, qui vise à déterminer la fonction et l'expression des gènes séquencés en caractérisant le transcriptome et le protéome. La génomique est l'équivalent de la métabolomique pour les métabolites. L'essor de cette discipline a été facilité par le développement des techniques de séquençage des génomes et la bio-informatique. en 1972, le premier véritable séquençage d'un génome est publié, avec la lecture de la séquence ARN du gène du virus bactériophage de Escherichia MS2. Elle a été très médiatisée à la fin du avec la compétition entre différentes équipes scientifiques pour la publication de la première carte du génome humain, annoncée conjointement le par Bill Clinton et Tony Blair. Depuis, un nombre croissant de génomes complets sont séquencés chez des espèces vivantes très différentes : le ver Caenorhabditis elegans en 1998, la mouche drosophile et la plante Arabidopsis thaliana en 2000 ou encore, le chien en 2005. En septembre 2007, une équipe menée par le biologiste et entrepreneur Craig Venter a publié le premier génome complet d'un individu qui se trouve être Craig Venter lui-même. Le génome du codécouvreur de la structure de l'ADN et ancien directeur du Projet génome humain, James Watson, a aussi été séquencé dans son intégralité à la même période. Connaitre la séquence nucléotidique permet une multitude d'études : Exploration des fonctions associées aux gènes, aux variations alléliques et au polymorphisme génétique ; Reconstruction d'arbres phylogénétique d'espèces vivantes ; Analyse de l'histoire évolutive des êtres vivants en lien avec leur écosystème Compréhension de maladies liées aux gènes Génomique structurale Cette branche de la génomique regroupe toutes les analyses de la structure des génomes (Ici « structure » est entendu au sens « organisation des génomes ») ; Les méthodes concernées sont donc le séquençage des génomes, l'identification des gènes, des séquences régulatrices, des séquences répétées, etc.

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Métabolomique

La métabolomique est une science très récente qui étudie l'ensemble des métabolites primaires (sucres, acides aminés, acides gras) et des métabolites secondaires dans le cas des plantes (polyphénols, flavonoïdes, alcaloïdes) présents dans une cellule, un organe ou un organisme. C'est l'équivalent de la génomique pour l'ADN. Elle utilise la spectrométrie de masse et la résonance magnétique nucléaire. Médecine : selon des chercheurs de la Harvard Medical School, les taux sanguins de cinq acides aminés (isoleucine, leucine, valine, tyrosine et phénylalanine) aideraient à prédire le risque de diabète.

Functional genomics

Functional genomics is a field of molecular biology that attempts to describe gene (and protein) functions and interactions. Functional genomics make use of the vast data generated by genomic and transcriptomic projects (such as genome sequencing projects and RNA sequencing). Functional genomics focuses on the dynamic aspects such as gene transcription, translation, regulation of gene expression and protein–protein interactions, as opposed to the static aspects of the genomic information such as DNA sequence or structures.

Interactome

In molecular biology, an interactome is the whole set of molecular interactions in a particular cell. The term specifically refers to physical interactions among molecules (such as those among proteins, also known as protein–protein interactions, PPIs; or between small molecules and proteins) but can also describe sets of indirect interactions among genes (genetic interactions). The word "interactome" was originally coined in 1999 by a group of French scientists headed by Bernard Jacq.

Lunaphore Technologies SA

Actif en biologie spatiale, en microfluidique et en automatisation. Lunaphore Technologies SA propose une technologie de changement de jeu avec une puce microfluidique brevetée unique qui accélère l'adoption de la biologie spatiale par l'automatisation, la qualité et la reproductibilité.

Genomsys

Active dans la génomique, la norme ISO et le traitement des données. GenomSys est une entreprise suisse pionnière en matière de solutions innovantes pour le traitement et l'analyse des données génomiques, utilisant la norme ISO IEC 23092 MPEG-G pour assurer une manipulation efficace des données génomiques.

This course will provide the fundamental knowledge in neuroscience required to understand how the brain is organised and how function at multiple scales is integrated to give rise to cognition and beh

Cancer is the second leading cause of death worldwide. Cancer develops through multiple hallmark functions including apoptosis evasion, unlimited replicative potential, metastasis, and immune avoidanc

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There are 377 Krüppel-associated box (KRAB) domain-containing zinc finger proteins (KZFPs) in the human genome, making them the largest family of transcription factors. KZFPs are defined by a N-termin

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Maxim Norkin

Colorectal cancer (CRC) is one of the deadliest cancers worldwide. Despite extensive research in the field, new therapies targeting CRC are in urgent need. CRC is a highly heterogeneous disease with h

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BIOENG-519: Methods: omics in biomedical research

High-throughput methodologies broadly called Omics allow to characterize the complexity and dynamics of any biological system. This course will provide a general description of different methods relat

Outils de génomique dans la recherche en neurosciences MOOC: Neuroscience Reconstructed: Genetics and Brain Development

Explore la régulation génique, les outils génomiques, le séquençage de l'ADN et la PCR dans la recherche en neurosciences.

ADN: PCR et techniques de séquençage MSE-212: Biology for engineers

Explore l'ingénierie de l'ADN à travers la PCR, le séquençage Sanger, le projet du génome humain, l'ADN recombinant, la manipulation de l'ADN bactérien et CRISPR / Cas9.

Méthodes de séquençage de l'ADN MICRO-560: BioMEMS

Explore les méthodes de séquençage de l'ADN comme Sanger, le pyroséquençage et les technologies de synthèse.

Génétique moléculaire

La génétique moléculaire est une branche de la biologie et de la génétique, qui consiste en l'analyse de la structure et de la fonction des gènes, normaux ou mutants, au niveau moléculaire. La détermination de la séquence ADN du génome de nombreux organismes vivants (virus, bactéries, plantes, animaux) permet également des études comparatives au niveau moléculaire, par comparaison bio-informatique des séquences.

Biologie moléculaire

redresse=1.67|vignette| Géométrie de la double hélice d'ADN B montrant le petit et le grand sillon ainsi que le détail des deux types de paires de bases : thymine–adénine en haut et cytosine–guanine en bas. La biologie moléculaire (parfois abrégée bio. mol.) est une discipline scientifique de la vie au croisement de la génétique, de la biochimie métabolique et de la physique, dont l'objet est la compréhension des mécanismes de fonctionnement de la cellule au niveau moléculaire.

Bio-informatique

La bioinformatique (ou bio-informatique), est un champ de recherche multidisciplinaire de la biotechnologie où travaillent de concert biologistes, médecins, informaticiens, mathématiciens, physiciens et bioinformaticiens, dans le but de résoudre un problème scientifique posé par la biologie. Plus généralement, la bio-informatique est l'application de la statistique et de l'informatique à la science biologique. Le spécialiste qui travaille à mi-chemin entre ces sciences et l'informatique est appelé bioinformaticien ou bionaute.