RhizariaLes Rhizaires aussi appelés Rhizariens (ou Rhizaria) sont un groupe d'organismes eucaryotes, le plus souvent unicellulaires. Ils peuvent vivre dans des eaux oligotrophes en s'associant symbiotiquement à des algues. Leur biomasse a longtemps été très sous-estimée, car ils sont si fragiles que le filet à plancton les détruit. Une méthodes d'échantillonnage non destructive (par caméra immergée) a permis en 2016 de réévaluer l'importance du super-groupe des Rhizaria : ces protistes représentent 33 % de l'abondance totale du plancton animal de grande taille à l'échelle de l'océan mondial et contribuent à 5 % de la biomasse marine globale.
EuglenophytaLes Euglenophyta ou Euglénophytes, ou encore Euglénoïdes constituent une classe de l’embranchement des Euglenozoa des Euglenobionta, composée principalement d’algues aquatiques unicellulaires. Les flagellés de ce groupe, qui comprend environ mille espèces, se trouvent couramment dans les eaux douces chargées de matières organiques ; il existe également quelques espèces marines et endosymbiotiques. La reproduction se fait par division cellulaire longitudinale.
ChrysophyceaeLes Chrysophyceae, ou Chrysophycées en français, sont une classe d’algues unicellulaires de couleur brun-jaune vivant souvent parmi le plancton en eau salée ou en eau douce. Leur couleur caractéristique est due aux pigments caroténoïdes qu'elles contiennent. Une chrysophycée possède généralement deux flagelles situés à l'une des extrémités de la cellule. Elles sont toutes photosynthétiques. Par exemple : Dinobryon, vivant en colonies en eau douce. Uroglena apiculata, dont le lac Léman a connu un développement exceptionnel en 1999.
HeliozoaHeliozoa, les héliozoaires, constituait un groupe d'actinopodes, aujourd'hui avéré polyphylétique. Ces espèces possèdent un squelette de silicate (SiO_2) ou chitinoïde (proche de la chitine, de nature glucidique). Aujourd'hui, une soigneuse étude de la phylogénie a permis de proposer l'embranchement monophylétique des héliozoaires recentré autour des Centrohelida. Les héliozoaires doivent leur nom au biologiste allemand Ernst Haeckel (1834-1919) qui les classifie en 1866 de manière différente des acanthaires et des radiolaires, groupes avec lesquels ils partagent des extensions cytoplasmiques appelés axopodes et un squelette minéral.
ApusomonadidaThe apusomonads (order Apusomonadida) are a group of protozoan zooflagellates that glide on surfaces, and mostly consume prokaryotes. They are of particular evolutionary interest because they appear to be the sister group to the Opisthokonts, the clade that includes both animals and fungi. Together with the Breviatea, these form the Obazoa clade. Apusomonads are small gliding heterotrophic biflagellates (= with two flagella) that possess a proboscis, formed partly or entirely by the anterior flagellum surrounded by a membranous sleeve.
OomycotaLes Oomycètes, c'est-à-dire la division des Oomycota ou classe des Oomycetes, comprennent entre (Kirk , 2001) d'organismes eucaryotes filamenteux. Ce sont des organismes aquatiques non photosynthétiques. Compte tenu de leurs ressemblances morphologiques ils ont été longtemps classés comme groupe proche des Fungi, au sein des champignons. Les analyses phylogénétiques ont montré que les Oomycètes appartiennent en réalité aux Straménopiles (ou hétérokontes), dont font aussi partie les algues brunes, mais au sein de ces derniers, ils sont monophylétiques.
HaptophytaLes Haptophytes, ou Haptophyta, sont une division d'algues unicellulaires (du groupe des Chromalveolata) — elles sont parfois appelées Prymnesiophyta, mais ce nom n'a jamais été validé — caractérisées par la présence d'un appendice particulier différent des flagelles, l'haptonème (appendice filiforme contenant des microtubules, dont la taille varie selon l’espèce, et qui permettrait l’adhésion à un substrat, le déplacement de particules voire la capture de proies). Le nombre d'espèces actuelles est estimé à environ 500.
EuglenaEuglena (les euglènes) est un genre commun d’algues vertes flagellées, typiques des Euglénophytes, et souvent présentes dans l’eau (le plus souvent de l'eau douce, mais il existe de rares espèces marines) riche en nutriments. Utilisant les chloroplastes (photosynthèse) pour se développer ou capable d'utiliser directement la matière organique, on considère l'euglène comme étant un organisme mixotrophe. La longueur des cellules varie de ; elles sont typiquement cylindriques, ovales, ou fusiformes avec une apparence de flagelle unique.
RadiolariaLes radiolaires, également appelés radiozoaires, sont des protozoaires d'un diamètre de 0,1 à 0,2 mm qui produisent des squelettes minéraux complexes, généralement avec une capsule centrale divisant la cellule en deux parties, l'endoplasme et l'ectoplasme, l'une interne et l'autre externe. Le squelette minéral est généralement constitué de silice. On les trouve sous forme de zooplancton dans tous les océans du monde.
GlaucophytaLes Glaucophytes (Glaucophyta), ou Glaucocystophytes, du grec γλαυκός [glaukos], « glauque » c'est-à-dire « vert ou bleu tirant vers le gris », et φυτ(ο) [phyt(o)], « végétal », constituent un groupe d'algues d'eau douce, de diversité réduite : seules 14 espèces ont été décrites et sont actuellement acceptées. Ce sont des organismes unicellulaires structurés dorso-ventralement, au dos arrondi et au ventre aplati et présentant deux flagelles de longueurs inégales. Ils nagent dans les mares d'eau douce des régions tempérées.
