La Guinée-Bissau est entourée au nord par le Sénégal, au sud et à l'est par la Guinée, et à l'ouest par l'océan Atlantique.
C'est un petit pays qui ne se trouve qu'à la position sur la liste des pays suivant leur superficie. celle-ci est de , dont de terre et de mer.
Le paysage est légèrement ondulé, mais en aucun point il ne dépasse les d'altitude. Le littoral se présente comme particulièrement déchiqueté. De longs estuaires fluviaux et bras de mer pénètrent loin à l'intérieur des terres.
Le pays n'a que des fleuves relativement petits, mais ces derniers, souvent abondants, se caractérisent par d'importants estuaires. Ceux-ci pénètrent profondément à l'intérieur des terres, et s'élargissent fortement sous l'effet de la marée.
Les principaux cours d'eau du pays sont:
Le Rio Geba
Le Rio Mansoa
Le Rio Cacheu
Le Rio Corubal
Le Rio Sao Martinho
La Guinée-Bissau est un des pays bien arrosés d'Afrique, malgré une assez longue saison sèche. Les précipitations alimentent des cours d'eau souvent abondants.
D'après Aquastat, la hauteur d'eau annuelle moyenne des précipitations est de millimètres, soit pour une superficie de kilomètres carrés, un volume de précipitations annuelles de cubes, arrondis à (contre par exemple au Portugal, pays 2,6 fois plus étendu - ou encore en Belgique, pays un peu moins étendu).
De ce volume précipité, l'évapo-transpiration consomme . Restent cubes de ressources produites sur le territoire du pays (en interne). Le pays reçoit en outre un important supplément d'eau provenant des pays voisins (essentiellement de la Guinée par le Rio Corubal, mais aussi du Sénégal par le Rio Geba) et se montant à . Les ressources totales en eau du pays atteignent donc annuellement cubes ( = 1 milliard de m).
La quantité d'eau disponible (qui comprend l'ensemble des ressources créées en interne, plus les apports extérieurs éventuels) est donc de par an, soit pour une population estimée à en 2008, pas moins de par habitant et par an.
phosphates, bauxite, pétrole (non exploité).
Le climat est tropical, chaud et humide.