Le bassin du Sistan est un bassin endoréique englobant de grandes parties du sud-ouest de l’Afghanistan et de petites parties du sud-est de l’Iran, une des régions les plus sèches du monde et une région soumise à des sécheresses prolongées. Son bassin hydrographique est un système de rivières s'écoulant des hautes terres afghanes vers des lacs et des marais d'eau douce, puis aboutissant à sa destination ultime: la dépression saline de Goud-e Zareh en Afghanistan, qui fait partie du vaste bassin terminal du Sistan. La rivière Helmand draine le plus grand bassin versant du bassin hydrologique, principalement alimentée par la fonte des neiges des montagnes de Hindou Kouch, mais d’autres rivières y contribuent également. Une colline basaltique, appelée Mont Khâdjeh, se dresse au bord des lacs et des marais du bassin. Le bassin du Sistan est bordé à l'ouest par le bassin du plateau central iranien, et au nord par le bassin aralo-caspien, endoréiques tous les deux ; à l'est par le bassin de l'Indus. La partie la plus basse du bassin du Sistan contient une série de lacs peu profonds, appelés hamuns. Il semble qu’il y ait eu un seul lac Hamun par le passé, mais il y a maintenant trois lacs séparés. Du nord au sud les lacs sont: Hamun-e Puzak se situe principalement en Afghanistan. Il reçoit de l'eau du canal Shelah Charkh de la rivière Helmand, ainsi que de la rivière Khash et d'autres petites rivières. Le Hamun-e Sabari est divisé entre l'Iran et l'Afghanistan. Il reçoit de l'eau provenant de la branche Parian de la rivière Helmand, de la rivière Farah et de la rivière Harut. La plus grande partie des eaux du fleuve Helmand se jettent dans le Hamoun-e Helmand, qui se trouve entièrement en Iran, par un canal connu sous le nom de Rud-e Sistan. En période d'inondation, les hamuns se joignent à un grand lac et tous les 20 ans environ, les eaux de crue provoquent un débordement du Hamun-e Helmand par une rivière normalement sèche appelée Shela Rud, qui se termine par la dépression de Goud-e Zareh.