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Concept

Gram négatif

Les bactéries à Gram négatif sont mises en évidence par une technique de coloration appelée coloration de Gram. Les bactéries à Gram négatif apparaissent alors roses au microscope. La technique de coloration révèle des caractéristiques membranaires et de paroi de la bactérie. Néanmoins, il ne s'agit pas d'un facteur de classement phylogénétique : en effet, les groupes Gram + et Gram − ne sont ni l'un ni l'autre monophylétiques. Principe de coloration Après fixation des bactéries sur une lame (deux méthodes possibles : fixation à l'éthanol à 90° (5 minutes) ou par passage de la lame dans la flamme, dite frottis) :

la lame est plongée dans un premier colorant : le violet de gentiane (1 minute). Le violet de gentiane, toxique et cancérigène, est un colorant puissant. Il va traverser les parois et membranes des bactéries et se fixer dans leurs cytoplasmes. Ainsi à cette étape toutes les cellules sont colorées en violet ;
la lame est ensuite traitée au lugol (diiode) en so

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Résumé

la lame est plongée dans un premier colorant : le violet de gentiane (1 minute). Le violet de gentiane, toxique et cancérigène, est un colorant puissant. Il va traverser les parois et membranes des bactéries et se fixer dans leurs cytoplasmes. Ainsi à cette étape toutes les cellules sont colorées en violet ;
la lame est ensuite traitée au lugol (diiode) en so

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Diversité du monde vivant, rôle et action des Procaryotes dans la biosphère. Fonctionnement biochimique des êtres vivants comprenant les voies métaboliques centrales et les fonctions des biomolécules majeures. Rôle central joué par l'information génétique, des mécanismes évolutifs et de régulation.

Biology is becoming more and more a data science, as illustrated by the explosion of available genome sequences. This course aims to show how we can make sense of such data and harness it in order to understand biological processes in a quantitative way.

Le cours "Microbiologie pour l'ingénieur" couvre les processus microbiens principaux qui ont lieu dans l'environnement et dans des systèmes de traitement. Il présente les cycles des éléments qui sont catalysés par des microorganismes et qui ont un impact important sur la planète Terre.

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Bactérie

Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux. Le plus souvent unicellulaires, elles sont parfois plu

Gram positif

Les bactéries à Gram positif sont mises en évidence par une technique de coloration appelée coloration de Gram. Cette technique de coloration, qui permet de classifier les bactéries dans deux catégo

Antibiotique

vignette|Gélules d'amoxicilline, l'un des antibiotiques les plus prescrits au monde, appartenant à la famille des bêta-lactamines. Un antibiotique (du grec anti : « contre », et bios : « la vie ») es

Quorum Sensing Contributes to Natural Transformation of Vibrio cholerae in a Species-Specific Manner

Melanie Blokesch, Patrick Martin Seitz, Gaia Francesca Marianne Suckow

Although it is a human pathogen, Vibrio cholerae is a regular member of aquatic habitats, such as coastal regions and estuaries. Within these environments, V. cholerae often takes advantage of the abundance of zooplankton and their chitinous molts as a nutritious surface on which the bacteria can form biofilms. Chitin also induces the developmental program of natural competence for transformation in several species of the genus Vibrio. In this study, we show that V. cholerae does not distinguish between species-specific and non-species-specific DNA at the level of DNA uptake. This is in contrast to what has been shown for other Gram-negative bacteria, such as Neisseria gonorrhoeae and Haemophilus influenzae. However, species specificity with respect to natural transformation still occurs in V. cholerae. This is based on a positive correlation between quorum sensing and natural transformation. Using mutant-strain analysis, cross-feeding experiments, and synthetic cholera autoinducer-1 (CAI-1), we provide strong evidence that the species-specific signaling molecule CAI-1 plays a major role in natural competence for transformation. We suggest that CAI-1 can be considered a competence pheromone.

American Society for Microbiology2011

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Fluorescent D-Amino Acids for Super-resolution Microscopy of the Bacterial Cell Wall

Juliette Griffie, Suliana Manley, Jiangtao Qiao, Luc Reymond, Ophélie Rutschmann, Faustine Ambroisine Charline Ryckebusch, Willi Leopold Stepp, Chen Zhang

Fluorescent D-amino acids (FDAAs) have previ-ously been developed to enable in situ highlighting of locations of bacterial cell wall growth. Most bacterial cells lie at the edge of the diffraction limit of visible light; thus, resolving the precise details of peptidoglycan (PG) biosynthesis requires super-resolution micros-copy after probe incorporation. Single molecule localization microscopy (SMLM) has stringent requirements on the fluorophore photophysical properties and therefore has remained challenging in this context. Here, we report the synthesis and characterization of new FDAAs compatible with one-step labeling and SMLM imaging. We demonstrate the incorporation of our probes and their utility for visualizing PG at the nanoscale in Gram-negative, Gram-positive, and mycobacteria species. This improved FDAA toolkit will endow researchers with a nanoscale perspective on the spatial distribution of PG biosynthesis for a broad range of bacterial species.

AMER CHEMICAL SOC2022

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Cecropins contribute to Drosophila host defense against a subset of fungal and Gram-negative bacterial infection

Alexia Laurie Carboni, Mark Austin Hanson, Bruno Lemaitre

Cecropins are small helical secreted peptides with antimicrobial activity that are widely distributed among insects. Genes encoding Cecropins are strongly induced upon infection, pointing to their role in host defense. In Drosophila, four cecropin genes clustered in the genome (CecA1, CecA2, CecB, and CecC) are expressed upon infection downstream of the Toll and Imd pathways. In this study, we generated a short deletion Delta Cec(A-C) removing the whole cecropin locus. Using the Delta Cec(A-C) deficiency alone or in combination with other antimicrobial peptide (AMP) mutations, we addressed the function of Cecropins in the systemic immune response. Delta Cec(A-C) flies were viable and resisted challenge with various microbes as wild-type. However, removing Delta Cec(A-C) in flies already lacking 10 other AMP genes revealed a role for Cecropins in defense against Gram-negative bacteria and fungi. Measurements of pathogen loads confirm that Cecropins contribute to the control of certain Gram-negative bacteria, notably Enterobacter cloacae and Providencia heimbachae. Collectively, our work provides the first genetic demonstration of a role for Cecropins in insect host defense and confirms their in vivo activity primarily against Gram-negative bacteria and fungi. Generation of a fly line (Delta AMP14) that lacks 14 immune inducible AMPs provides a powerful tool to address the function of these immune effectors in host-pathogen interactions and beyond.

OXFORD UNIV PRESS INC2022

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