Endolithe

vignette|Prélèvement de cyanobactéries endolithiques dans du granite.|alt=instruments d'échantillonnage de cyanobactéries dans des fissures de granit. Un endolithe est un organisme vivant au sein de roches, dans leurs pores, leurs fissures ou entre les grains minéraux qui la constituent, participant à la biométéorisation de ces roches dont il tire son alimentation. Les micro-organismes endolithiques peuvent être des archées, des bactéries et cyanobactéries, des microchampignons ou lichens, des algues voire des amibes. Par extension, on nomme aussi endolithes les micro-organismes qui vivent dans le corail et des coquilles animales. Les endolithes sont souvent des organismes extrêmophiles trouvés dans des endroits longtemps supposés inhospitaliers pour la vie. Parce qu'ils sont adaptés au manque d'eau, au gel et aux écarts extrêmes de température, ils intéressent les astrobiologistes, qui ont théorisé de possibles environnements endolithiques sur Mars et d'autres planètes. On a récemment montré que certaines bactéries cyanophycées endolithes peuvent produire de l'oxygène par photosynthèse si la roche est assez transparente, et qu'elles peuvent aussi produire du méthane. vignette|redresse=1.5|Types d'organismes endolithiques colonisant un substrat rocheux cohérent, friable ou meuble. Les géobiologistes distinguent : des chasmoendolites ou chasmolites, vivant dans des fissures ; des cryptoendolites, vivant dans des cavités, et des euendolithes qui creusent dans la roche. Les espèces épilithes se développent à la surface du substrat rocheux. Cette distinction n'est pas toujours évidente, si bien qu'il est parfois fait mention d'espèces à thalle hémi-endolithique (à la fois endolithique et épilithique). Des endolithes ont été découvertes en milieu terrestre et marin, des pôles aux montagnes en passant par les déserts, et jusqu'à 3 kilomètres de profondeur, et il pourrait en exister plus profondément. Là, la pression due à la profondeur et l'exposition à des métalloïdes et métaux lourds toxiques et à des conditions acides semble être une menace moins importante que l'augmentation de la température.