Résumé
En biochimie, une ligase est une enzyme qui catalyse la jonction de deux molécules (en anglais ligation) par de nouvelles liaisons covalentes avec hydrolyse concomitante de l'ATP ou d'autres molécules similaires. Elle forme des liaisons phosphodiesters de l'extrémité 3' hydroxylée à l'extrémité 5' phosphorilée. Le nom courant des enzymes de type ligase inclut souvent le terme « ligase » comme l'ADN ligase du phage T4 utilisée pour structurer des fragments d'ADN. D'autres noms courants utilisent le mot « synthétase » car ces enzymes catalysent la synthèse de nouvelles molécules. Attention cependant à ne pas confondre les enzymes synthétases avec les enzymes synthases (qui sont toutes deux des enzymes du groupe des ligases). Les synthases, contrairement aux synthétases, n'utilisent pas l'énergie libérée par la déphosphorylation des nucléotides triphosphatés (comme l'ATP, la GTP, la CTP, la TTP et l'UTP) pour catalyser sa réaction. En fait la synthase forme et défait les doubles liaisons d'une protéine... Les ligases sont classées EC 6 dans la nomenclature EC des enzymes. Cette classe peut ensuite être divisée en six sous-classes : EC 6.1.1.1 tyrosine ARNt ligase EC 6.1.1.2 tryptophane ARNt ligase EC 6.1.1.3 thréonine ARNt ligase EC 6.1.1.4 leucine ARNt ligase EC 6.1.1.5 isoleucine ARNt ligase EC 6.1.1.6 lysine ARNt ligase EC 6.1.1.7 alanine ARNt ligase EC 6.1.1.8 supprimé EC 6.1.1.9 valine ARNt ligase EC 6.1.1.10 methionine ARNt ligase EC 6.1.1.11 serine ARNt ligase EC 6.1.1.12 aspartate ARNt ligase EC 6.1.1.13 D-alanine-poly(phosphoribitol) ligase EC 6.1.1.14 glycine ARNt ligase EC 6.1.1.15 proline ARNt ligase EC 6.1.1.16 cysteine ARNt ligase EC 6.1.1.17 glutamate ARNt ligase EC 6.1.1.18 glutamine ARNt ligase EC 6.1.1.19 arginine ARNt ligase EC 6.1.1.20 phenylalanine ARNt ligase EC 6.1.1.21 histidine ARNt ligase EC 6.1.1.22 asparagine ARNt ligase EC 6.1.1.23 aspartate ARNt Asn ligase EC 6.1.1.24 glutamate ARNtGln ligase EC 6.1.1.25 supprimé EC 6.1.1.26 pyrrolysine ARNt Pyl ligase EC 6.1.1.27 O-phosphoserine ARNt ligase EC 6.
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