En biochimie, une ligase est une enzyme qui catalyse la jonction de deux molécules (en anglais ligation) par de nouvelles liaisons covalentes avec hydrolyse concomitante de l'ATP ou d'autres molécules similaires. Elle forme des liaisons phosphodiesters de l'extrémité 3' hydroxylée à l'extrémité 5' phosphorilée.
Le nom courant des enzymes de type ligase inclut souvent le terme « ligase » comme l'ADN ligase du phage T4 utilisée pour structurer des fragments d'ADN. D'autres noms courants utilisent le mot « synthétase » car ces enzymes catalysent la synthèse de nouvelles molécules.
Attention cependant à ne pas confondre les enzymes synthétases avec les enzymes synthases (qui sont toutes deux des enzymes du groupe des ligases). Les synthases, contrairement aux synthétases, n'utilisent pas l'énergie libérée par la déphosphorylation des nucléotides triphosphatés (comme l'ATP, la GTP, la CTP, la TTP et l'UTP) pour catalyser sa réaction. En fait la synthase forme et défait les doubles liaisons d'une protéine...
Les ligases sont classées EC 6 dans la nomenclature EC des enzymes. Cette classe peut ensuite être divisée en six sous-classes :
EC 6.1.1.1 tyrosine
ARNt ligase
EC 6.1.1.2 tryptophane
ARNt ligase
EC 6.1.1.3 thréonine
ARNt ligase
EC 6.1.1.4 leucine
ARNt ligase
EC 6.1.1.5 isoleucine
ARNt ligase
EC 6.1.1.6 lysine
ARNt ligase
EC 6.1.1.7 alanine
ARNt ligase
EC 6.1.1.8 supprimé
EC 6.1.1.9 valine ARNt ligase
EC 6.1.1.10 methionine
ARNt ligase
EC 6.1.1.11 serine
ARNt ligase
EC 6.1.1.12 aspartate
ARNt ligase
EC 6.1.1.13 D-alanine-poly(phosphoribitol) ligase
EC 6.1.1.14 glycine
ARNt ligase
EC 6.1.1.15 proline
ARNt ligase
EC 6.1.1.16 cysteine ARNt
ligase
EC 6.1.1.17 glutamate
ARNt ligase
EC 6.1.1.18 glutamine
ARNt ligase
EC 6.1.1.19 arginine ARNt ligase
EC 6.1.1.20 phenylalanine
ARNt ligase
EC 6.1.1.21 histidine
ARNt ligase
EC 6.1.1.22 asparagine
ARNt ligase
EC 6.1.1.23 aspartate
ARNt Asn ligase
EC 6.1.1.24 glutamate
ARNtGln ligase
EC 6.1.1.25 supprimé
EC 6.1.1.26 pyrrolysine
ARNt Pyl ligase
EC 6.1.1.27 O-phosphoserine ARNt ligase
EC 6.
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En biochimie, une ligase est une enzyme qui catalyse la jonction de deux molécules (en anglais ligation) par de nouvelles liaisons covalentes avec hydrolyse concomitante de l'ATP ou d'autres molécules similaires. Elle forme des liaisons phosphodiesters de l'extrémité 3' hydroxylée à l'extrémité 5' phosphorilée. Le nom courant des enzymes de type ligase inclut souvent le terme « ligase » comme l'ADN ligase du phage T4 utilisée pour structurer des fragments d'ADN.
Les polymérases sont des enzymes qui ont pour rôle la synthèse d'un brin de polynucléotide (ADN ou ARN), le plus souvent en utilisant un brin complémentaire comme matrice et des nucléotides triphosphate (NTP ou dNTP) comme monomères. Les polymérases synthétisent le nouveau brin dans le sens 5’ vers 3’, en formant une nouvelle liaison phosphodiester entre le 3'-OH du brin allongé et le 5'-phosphate du nucléotide triphosphate ajouté. Ceci s'accompagne de la libération de pyrophosphate provenant de l'hydrolyse du NTP ou dNTP.
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EPFL2008
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