Organisme (physiologie)thumb|Les bactéries Escherichia coli sont des organismes unicellulaires. Un organisme (du grec organon, « instrument »), ou organisme vivant, est, en biologie et en écologie, un système vivant complexe, organisé et est le produit de variations successives au cours de l'évolution. Il est constitué d'une ou plusieurs cellules vivantes (on parle alors, respectivement, d'organisme unicellulaire ou pluricellulaire). Les organismes vivants sont classifiés en espèces partageant des caractéristiques génétiques, biologiques et morphologiques communes.
AcetogenAn acetogen is a microorganism that generates acetate (CH3COO−) as an end product of anaerobic respiration or fermentation. However, this term is usually employed in a narrower sense only to those bacteria and archaea that perform anaerobic respiration and carbon fixation simultaneously through the reductive acetyl coenzyme A (acetyl-CoA) pathway (also known as the Wood-Ljungdahl pathway). These genuine acetogens are also known as "homoacetogens" and they can produce acetyl-CoA (and from that, in most cases, acetate as the end product) from two molecules of carbon dioxide (CO2) and four molecules of molecular hydrogen (H2).
Étherlipidevignette|Structure d'un plasmalogène. vignette|Archéol. vignette|Caldarchéol. vignette|Crénarchéol. vignette|Structures d'une bicouche lipidique (9) et d'une « monocouche » propre à certaines archées (10). vignette|Facteur d'activation plaquettaire. Un étherlipide, parfois appelé alcoxyglycéride, est un glycéride dans lequel une fonction alcool du glycérol, généralement l'hydroxyle du carbone en position 1, est combinée à un alcool gras par une liaison éther, contrairement aux lipides usuels, dans lesquels les groupes hydroxyle du glycérol sont combinés à un acide gras par une liaison ester.
ThermoacidophileA thermoacidophile is an extremophilic microorganism that is both thermophilic and acidophilic; i.e., it can grow under conditions of high temperature and low pH. The large majority of thermoacidophiles are archaea (particularly the Thermoproteota and "Euryarchaeota") or bacteria, though occasional eukaryotic examples have been reported. Thermoacidophiles can be found in hot springs and solfataric environments, within deep sea vents, or in other environments of geothermal activity.
HalobacteriumHalobacterium est un genre d'archées halophiles de la famille des Halobacteriaceae. Il regroupe plusieurs espèces aérobies dont le métabolisme nécessite un environnement à forte teneur en sels dissous car de nombreuses enzymes de ces organismes sont inopérantes dans les environnements pauvres en sels. Ces cellules se présentent sous forme de bâtonnets ou de coques de couleur rouge ou violette, avec des parois cellulaires différentes de celles des bactéries car ces dernières ne résistent pas aux environnements trop riches en sels, et se développent en présence d'acides aminés en conditions aérobies.
PiézophileLes organismes piézophiles (« piezzophiles », ou « barophiles ») sont des êtres vivants qui ne peuvent vivre qu'en pression hyperbare (à des pressions très élevées) comme les bactéries et plus particulièrement les Archaea vivant dans les grands-fonds océaniques. De vertébrés, invertébrés et des micro-organismes (surtout des procaryotes) sont trouvés là où la pression dépasse souvent les (environ ). Certains de ces organismes piézophiles ont été découverts au fond de l'océan Pacifique où la pression était de .
ThermoplasmaThermoplasma est un genre d'archées thermophiles et acidophiles de la famille des Thermoplasmataceae. Ce sont des microorganismes anaérobies facultatifs dont la respiration cellulaire utilise le soufre et le carbone organique. Elles sont dépourvues de paroi cellulaire et possèdent une membrane plasmique simple constituée d'un lipoglycane comprenant des étherlipides tétraéther atypiques liés à un oligosaccharide contenant du glucose et du mannose. On pense que c'est ce lipoglycane qui assure la résistance de cellule contre l'acidité et la température.
MésophileUn organisme mésophile est une forme de vie qui prospère au mieux dans des conditions moyennes du gradient sécheresse-humidité. Classiquement, on parle de bactéries mésophiles lorsqu'elles vivent à des températures comprises entre 20 et (bactéries mésothermes) et dans des conditions moyennes d'humidité. Au point de vue de la température, les écologues distinguent trois flores : la flore cryophile (5 à 20°), mésophile (20 à 35°) et thermophile (35 à 42°). Ils distinguent aussi les espèces thermophobes, ne supportant pas des températures élevées.
Pansethumb|upright=1.4|Système digestif d'un ruminant (vache).m. œsophage, v. rumen ou panse, n. réticulum ou réseau, b. omasum ou feuillet, l. abomasum ou caillette, t. partie pylorique de la caillette. La panse, aussi appelée rumen, est le premier des quatre compartiments du système digestif des ruminants. Il est de loin le plus volumineux et joue un rôle indispensable dans la dégradation des nutriments par le processus de fermentation anaérobie par le microbiote du rumen.
Nitrificationthumb|350px|Diagramme montrant le cycle de l'azote. La nitrification est le processus biologique par lequel les nitrates sont produits dans l'environnement. Celle-ci se fait en deux étapes distinctes, chacune sous l'action de micro-organismes différents. Étape 1 : l'ammoniaque est oxydé en nitrite, c'est la nitrosation (réaction par des bactéries du genre Nitrosomonas, , ), appelée également nitritation. Étape 2 : le nitrite est oxydé en nitrate, c'est la nitratation (réaction par des bactéries du genre Nitrobacter, Nitrococcus, Nitrospira).
