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Concept
Pseudomonadota
Résumé
Les Pseudomonadota – anciennement Proteobacteria (en français les Protéobactéries) – sont un vaste embranchement (ou division, ou phylum) du règne des Bacteria. C'est l'un des taxons bactériens les mieux caractérisés en raison de ses multiples recoupements avec la santé et les activités humaines. On y trouve en effet de nombreux genres pathogènes tels que Brucella, Rickettsia, Bordetella, Neisseria, Legionella, Pseudomonas, Vibrio, un grand nombre d'Entérobactéries, Helicobacter, mais aussi des bactéries impliquées dans la fixation biologique de l'azote (Azotobacter, Rhizobium, Bradyrhizobium), la production d'acide acétique (Acetobacteraceae) ou encore l'altération des minéraux (Burkholderiales) et la bioremédiation (Acinetobacter, Arthrobacter, Ideonella).
Ce groupe de bactéries a d'abord été appelé «Bactéries pourpres et proches» par Carl Woese en . Ensuite Proteobacteria a été proposé comme une classe par Stackebrandt en afin de les y regrouper. En , les protéobactéries sont élevées au niveau de phylum pour toutes les bactéries dont la séquence ARNr 16S est proche de celles de l'ordre des Pseudomonadales, ordre type de ce phylum.
Le terme protéobactéries provient du dieu grec Protée, une divinité marine qui avait la capacité de se métamorphoser, en référence à la grande variété de formes au sein de ce groupe. Il n'a pas été nommé ainsi du fait de l'existence d'un genre bactérien nommé Proteus appartenant aux Protéobactéries. Il a récemment été renommé Pseudomonadota par l'ICSP () .
Le groupe des Proteobacteria a d'abord été défini sur la base des séquences de l'ARN ribosomique (ARNr). Ensuite il a été élevé en tant que phylum avec cinq classes à la sortie de Bergeys de 2005. Les classes étant Alphaproteobacteria, Bbetaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Deltaproteobacteria et Espilonproteobacteria. Chacune d'entre elles est monophylétique.
En , Emerson proposent l'ajout de la classe Candidatus ZetaProteobacteria mais sa publication est jugée invalide.
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