Liaison génétique

La liaison génétique (ou genetic linkage) est le fait que les valeurs de deux gènes différents ont tendance à être transmis ensemble d'un individu à sa descendance. Cela se produit s'ils sont situés sur le même chromosome et proches l'un de l'autre ; en termes techniques, si leurs locus, les secteurs de l'ADN où leurs allèles se trouvent, sont voisins. Une liaison génétique se distingue d'une liaison physique : deux gènes qui se trouvent sur le même chromosome sont physiquement liés, mais peuvent être génétiquement indépendants, on dit alors qu'ils sont syntènes. On mesure la distance entre gènes par une unité abstraite, le cM (centimorgans), correspondant à la probabilité que les deux gènes soient séparés par un crossing-over. Un ensemble de gènes liés forme un haplotype, qui permet d'étudier l'évolution et les mouvements des populations dans le temps, notamment l'origine de l'humanité. Théorie En théorie, plus la distance entre deux locus de deux gènes est faible, moins

À propos de ce résultat

Cette page est générée automatiquement et peut contenir des informations qui ne sont pas correctes, complètes, à jour ou pertinentes par rapport à votre recherche. Il en va de même pour toutes les autres pages de ce site. Veillez à vérifier les informations auprès des sources officielles de l'EPFL.

Publications associées (33)

Publications associées

Chargement

Personnes associées (3)

Personnes associées

Chargement

Unités associées (2)

Unités associées

Chargement

Concepts associés (39)

Concepts associés

Chargement

Cours associés (16)

Cours associés

Chargement

Séances de cours associées (29)

Séances de cours associées

Chargement

Clinical and genetic investigation of a large Tunisian family with complete achromatopsia: identification of a new nonsense mutation in GNAT2 gene

Farah Ouechtati

Complete achromatopsia is a rare autosomal recessive disease associated with CNGA3, CNGB3, GNAT2 and PDE6C mutations. This retinal disorder is characterized by complete loss of color discrimination due to the absence or alteration of the cones function. The purpose of the present study was the clinical and the genetic characterization of achromatopsia in a large consanguineous Tunisian family. Ophthalmic evaluation included a full clinical examination, color vision testing and electroretinography. Linkage analysis using microsatellite markers flanking CNGA3, CNGB3, GNAT2 and PDE6C genes was performed. Mutations were screened by direct sequencing. A total of 12 individuals were diagnosed with congenital complete achromatopsia. They are members of six nuclear consanguineous families belonging to the same large consanguineous family. Linkage analysis revealed linkage to GNAT2. Mutational screening of GNAT2 revealed three intronic variations c.119-69G > C, c.161+66A > T and c.875 31G > C that co-segregated with a novel mutation p.R313X. An identical GNAT2 haplotype segregating with this mutation was identified, indicating a founder mutation. All patients were homozygous for the p.R313X mutation. This is the first report of the clinical and genetic investigation of complete achromatopsia in North Africa and the largest family with recessive achromatopsia involving GNAT2; thus, providing a unique opportunity for genotype-phenotype correlation for this extremely rare condition. Journal of Human Genetics (2011) 56, 22-28; doi:10.1038/jhg.2010.128; published online 25 November 2010

2011

Chargement

Synthesis of 6-benzylguanine derivatized oligonucleotides for genotype-phenotype linkage with AGT fusion proteins for In Vitro Compartmentalisation

EPFL2004

Chargement

Seascape Genomics of the Sugar Kelp Saccharina latissima along the North Eastern Atlantic Latitudinal Gradient

Chloé Christiane Laurence Jollivet, Stéphane Mauger

Temperature is one of the most important range-limiting factors for many seaweeds. Driven by the recent climatic changes, rapid northward shifts of species' distribution ranges can potentially modify the phylogeographic signature of Last Glacial Maximum. We explored this question in detail in the cold-tolerant kelp species Saccharina latissima, using microsatellites and double digest restriction site-associated DNA sequencing ( ddRAD-seq) derived single nucleotide polymorphisms (SNPs) to analyze the genetic diversity and structure in 11 sites spanning the entire European Atlantic latitudinal range of this species. In addition, we checked for statistical correlation between genetic marker allele frequencies and three environmental proxies (sea surface temperature, salinity, and water turbidity). Our findings revealed that genetic diversity was significantly higher for the northernmost locality (Spitsbergen) compared to the southern ones (Northern Iberia), which we discuss in light of the current state of knowledge on phylogeography of S. latissima and the potential influence of the recent climatic changes on the population structure of this species. Seven SNPs and 12 microsatellite alleles were found to be significantly associated with at least one of the three environmental variables. We speculate on the putative adaptive functions of the genes associated with the outlier markers and the importance of these markers for successful conservation and aquaculture strategies for S. latissima in this age of rapid global change.

MDPI2020

Chargement

Génétique

thumb|upright=1.5|De la molécule d'ADN à la cellule vivante. Le nom de génétique vient de l'adjectif grec , qui qualifie « ce qui est en rapport aux fonctions de génération ». Il dérive du grec , «

Gène

Un gène, du grec ancien (« génération, naissance, origine »), est, en biologie, une séquence discrète et héritable de nucléotides dont l'expression affecte les caractères d'un organisme. L'ensemble

Lois de Mendel

Les lois de Mendel sont trois lois concernant les principes de l'hérédité biologique, énoncées par le moine et botaniste de nationalité austro-hongroise Gregor Mendel (1822-1884). La redécouverte de

BIO-109: Introduction to life sciences (for IC)

Ce cours présente les principes fondamentaux à l'œuvre dans les organismes vivants. Autant que possible, l'accent est mis sur les contributions de l'Informatique aux progrès des Sciences de la Vie.

BIO-105: Cellular biology and biochemistry for engineers

Basic course in biochemistry as well as cellular and molecular biology for non-life science students enrolling at the Master or PhD thesis level from various engineering disciplines. It reviews essential notions necessary for a training in biology-related engineering fields.

BIO-373: Genetics and genomics

The theoretical part of this course covers classical genetics and contemporary genomics. Because bioinformatics has become important for genomic research, the course also includes practical applications to genomic analyses using Python, including group projects.