Êtes-vous un étudiant de l'EPFL à la recherche d'un projet de semestre?
Travaillez avec nous sur des projets en science des données et en visualisation, et déployez votre projet sous forme d'application sur Graph Search.
La liaison génétique (ou genetic linkage) est le fait que les valeurs de deux gènes différents ont tendance à être transmis ensemble d'un individu à sa descendance. Cela se produit s'ils sont situés sur le même chromosome et proches l'un de l'autre ; en termes techniques, si leurs locus, les secteurs de l'ADN où leurs allèles se trouvent, sont voisins. Une liaison génétique se distingue d'une liaison physique : deux gènes qui se trouvent sur le même chromosome sont physiquement liés, mais peuvent être génétiquement indépendants, on dit alors qu'ils sont syntènes. On mesure la distance entre gènes par une unité abstraite, le cM (centimorgans), correspondant à la probabilité que les deux gènes soient séparés par un crossing-over. Un ensemble de gènes liés forme un haplotype, qui permet d'étudier l'évolution et les mouvements des populations dans le temps, notamment l'origine de l'humanité. En théorie, plus la distance entre deux locus de deux gènes est faible, moins il y a de risques qu'un enjambement ne les sépare lors de la méiose, donc moins le phénotype qui découlera des différents gamètes obtenus différera des phénotypes parentaux pour les caractères étudiés. Cette observation permet de déduire la distance génétique entre deux gènes. (Attention : il ne s'agit pas ici de la distance génétique mesurant la différence entre 2 génomes ; il s'agit bien d'une indépendance physique de 2 locus pour l'hérédité.) On détermine la distance génétique entre deux locus en étudiant la fréquence des phénotypes après un croisement : si la fréquence en gamètes recombinés est égale à la fréquence en gamètes parentaux (donc égale à 1/2), on dit qu'il y a indépendance génétique. Cela ne signifie pas que les deux gènes étudiés sont physiquement indépendants (c'est-à-dire sur deux chromosomes différents). Cependant, on parlera d'indépendance génétique s'il y a indépendance physique, ou bien si les deux gènes étudiés sont à une distance tellement importante que la probabilité d'avoir un enjambement est extrêmement élevée.
Mark Pauly, Francis Julian Panetta, Seiichi Eduardo Suzuki Erazo, Quentin Christian Becker, Yingying Ren, Davide Pellis