Ouganda | EPFL Graph Search

LOuganda, en forme longue la république d'Ouganda ou la république de l'Ouganda, (en anglais : Uganda et Republic of Uganda, en swahili : Uganda et Jamhuri ya Uganda), est un pays d'Afrique de l'Est. Il est aussi considéré comme faisant partie de l'Afrique des Grands Lacs. Il est entouré par la République démocratique du Congo à l'ouest, le Kenya à l'est, le Rwanda au sud-ouest, le Soudan du Sud au nord et la Tanzanie au sud. Le Sud du pays englobe une vaste partie du lac Victoria. L'Ouganda tire son nom du royaume de Buganda, qui couvrait autrefois les régions les plus au sud, dont la capitale et plus grande ville est Kampala. L'Ouganda est un pays membre de l'Organisation de la coopération islamique. Le territoire devient un protectorat britannique en 1894 et obtient son indépendance en 1962 sous le premier ministre Milton Obote, qui accède à la présidence en 1966 en transformant le régime parlementaire en régime présidentiel. En 1967, le pays devient une république et abolit les monarchies précoloniales. La plupart des monarchies sont rétablies dans les années 1990 en tant que monarchies constitutionnelles. En 1971, Obote est renversé et remplacé par Idi Amin Dada lors d'un coup d'État. Amin impose une dictature brutale jusqu'à son renversement en 1979 par la guerre ougando-tanzanienne. Une guerre de brousse éclate l'année suivante contre le gouvernement restauré d'Obote. En 1986, le Mouvement de résistance nationale gagne la guerre et Yoweri Museveni accède à la présidence. Grâce aux amendements constitutionnels, il reste le président actuel. Géographie de l'Ouganda thumb|Carte de l'Ouganda Le pays est situé sur le plateau Est-africain, pour la plus grande partie entre les nord et sud et entre les et est. Son altitude moyenne est de , en descente abrupte vers la plaine soudanaise au nord. Le centre s’articule autour du lac Kyoga, entouré de zones marécageuses. La quasi-totalité du territoire ougandais se trouve dans le bassin du Nil. Le Nil sort du lac Victoria pour rejoindre le lac Kyoga puis le lac Albert, sur la frontière avec la république démocratique du Congo.

Host genetic predictors of the kynurenine pathway of tryptophan catabolism among treated HIV-infected Ugandans

Yunfei Huang

Objective: Plasma kynurenine/tryptophan ratio, a biomarker of indoleamine 2,3-dioxygenase-1 (IDO) activity, is a strong independent predictor of mortality in HIV-infected Ugandans initiating antiretroviral therapy (ART) and may play a key role in HIV pathogenesis. We performed a genome-wide study to identify potential host genetic determinants of kynurenine/tryptophan ratio in HIV-infected ART-suppressed Ugandans. Design/methods: We performed genome-wide and exome array genotyping and measured plasma kynurenine/tryptophan ratio during the initial 6-12 months of suppressive ART in Ugandans. We evaluated more than 16 million single nucleotide polymorphisms in association with log(10) kynurenine/tryptophan ratio using linear mixed models adjusted for cohort, sex, pregnancy, and ancestry. Results: Among 597 Ugandans, 62% were woman, median age was 35, median baseline CD4(+) cell count was 135 cells/mu l, and median baseline HIV-1 RNA was 5.1 log(10) copies/ml. Several polymorphisms in candidate genes TNF, IFNGR1, and TLR4 were associated with log(10) kynurenine/tryptophan ratio (P < 5.0 x 10(-5)). An intergenic polymorphism between CSPG5 and ELP6 was genome-wide significant, whereas several others exhibited suggestive associations (P < 5.0 x 10(-7)), including genes encoding protein tyrosine phosphatases (PTPRM and PTPRN2) and the vitamin D metabolism gene, CYP24A1. Several of these single nucleotide polymorphisms were associated with markers of inflammation, coagulation, and monocyte activation, but did not replicate in a small US cohort (N = 262; 33% African-American). Conclusion: Our findings highlight a potentially important role of IFN-gamma, TNF-alpha, and Toll-like receptor signaling in determining IDO activity and subsequent mortality risk in HIV-infected ART-suppressed Ugandans. These results also identify potential novel pathways involved in IDO immunoregulation. Further studies are needed to confirm these findings in treated HIV-infected populations. Copyright (C) 2016 Wolters Kluwer Health, Inc. All rights reserved.

Lippincott Williams & Wilkins2016

Host genetic predictors of the kynurenine pathway of tryptophan catabolism among treated HIV-infected Ugandans

Yunfei Huang

Lippincott Williams & Wilkins2016