L'archéogénétique (en anglais archaeogenetics), un terme inventé par l'archéologue britannique et le paléolinguiste Colin Renfrew, se réfère à l'application des techniques moléculaires de génétique des populations à l'étude du passé humain. Cela peut impliquer :
L'analyse de l'ADN ancien récupéré à partir de restes archéologiques ;
L'analyse de l'ADN des populations modernes (y compris les humains et les espèces domestiques et animales) afin d'étudier le passé humain et l'héritage génétique de l'interaction humaine avec la biosphère ;
L'application de méthodes statistiques développées par les généticiens moléculaires aux données archéologiques.
La même expression a également été utilisée par Antonio Amorim (1999) et définie comme : l'obtention et l'interprétation de la preuve [génétique] de l'histoire de l'homme.
L'archéogénétique peut être appuyé dans son travail d'investigation par la paléogénétique et, depuis peu, par la paléogénomique. Elle est l'une des disciplines connexes à l'archéogéographie et à la géographie génétique.
L'archéogénétique a son origine dans l'étude des groupes sanguins humains et la réalisation que ce marqueur génétique classique fournit des informations sur les relations entre groupes linguistiques et ethniques. Les premiers travaux dans ce domaine comprenaient celui de Ludwik et Hanka Hirszfeld, et Arthur Mourant. À partir des années 1960, Luca Cavalli-Sforza a utilisé des marqueurs génétiques classiques pour examiner la population préhistorique d'Europe, qui a abouti à la publication de The History and Geography of Human Genes en 1994.
Depuis lors, l'histoire génétique de l'ensemble de nos principales plantes domestiques, tel le blé, le riz et le maïs, et les animaux, tels les bovins, les chèvres, les porcs et les chevaux, a été analysée. Des modèles pour le chronométrage et la biogéographie de leur domestication et de l'élevage subséquent ont été avancés, principalement en fonction de la variation de l'ADN mitochondrial, bien que d'autres marqueurs soient actuellement analysés pour compléter le récit génétique (par exemple, le chromosome Y pour décrire l'histoire de la lignée masculine).