In the field of drug discovery, classical pharmacology, also known as forward pharmacology, or phenotypic drug discovery (PDD), relies on phenotypic screening (screening in intact cells or whole organisms) of chemical libraries of synthetic small molecules, natural products or extracts to identify substances that have a desirable therapeutic effect. Using the techniques of medicinal chemistry, the potency, selectivity, and other properties of these screening hits are optimized to produce candidate drugs.
Classical pharmacology traditionally has been the basis for the discovery of new drugs. Compounds are screened in cellular or animal models of disease to identify compounds that cause a desirable change in phenotype. Only after the compounds have been discovered, an effort is made to determine the biological target of the compounds through target validation experiments often involving chemoproteomics. More recently it has become popular to develop a hypothesis that a certain biological target is disease modifying and screen for compounds that modulate the activity of this purified target. Afterwards, these compounds are tested in animals to see if they have the desired effect. This approach is known as "reverse pharmacology" or "target based drug discovery" (TDD). However, recent statistical analysis reveals that a disproportionate number of first-in-class drugs with novel mechanisms of action come from phenotypic screening, which has led to a resurgence of interest in this method.
Pharmacognosy, the investigation of botanics used in indigenous medical traditions is essentially classical pharmacology. Pharmacognosy and classical pharmacology are both often contrasted with reverse pharmacology, that is, working from the target backward to identify new drugs starting with screening libraries of compounds for affinity for particular target. In pharmacognosy, folk medicines are first tested in clinical trials for efficacy. Only after efficacy has been established, is an effort made to determine the biologic target of the drug.
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The course discusses methods in modern drug development. Each week, a short introduction to a drug development method / field is provided and a recent research paper is discussed in depth. Students pa
We will cover key concepts of Medicinal Chemistry, from identification of active chemical starting points to how they are optimized to deliver drug candidates. We will use real case studies from the p
This course discusses the molecular basis of diseases and how drugs work. Concepts and processes employed in today's drug discovery and development are covered. The first part of the course focuses on
Couvre la biologie chimique, le dépistage à haut débit, l'interférence de l'ARN, le CRISPR-Cas9 et la différenciation organoid pour la découverte de médicaments.
Explore les récepteurs nucléaires, leur rôle dans la pharmacologie des médicaments et les fonctions physiologiques dans le tissu adipeux et l'homéostasie du glucose.
Une chimiothèque est une banque de données de molécules. Les chimiothèques peuvent contenir de plusieurs dizaines à plusieurs millions de composés chimiques. Selon leur contenu (chémotype, châssis moléculaire, diversité, , etc.), leur mode de stockage et leur provenance, il est possible de classer les chimiothèques en différentes catégories. On distingue, par exemple: les chimiothèques virtuelles, où les composés chimiques sont entreposés sous forme de données électroniques ; les chimiothèques focalisées sur un type de substance, lorsque le contenu ne se préoccupe que d’un espace chimique restreint.
La chimioprotéomique (chimio, racine française) ou chemoprotéomique (chemo, racine latine ; provenant du mot anglais chemoproteomics) ou protéomique chimique peut être définie comme la science ayant pour objet l'étude de la réponse d'un protéome à un composé chimique. Elle est une sous-discipline de la biologie chimique, qui utilise les techniques de protéomique et en particulier le séquençage des protéines par spectrométrie de masse pour étudier les interactions d'une molécule avec les protéines contenues dans un échantillon biologique.
Une cible thérapeutique est un élément quelconque d'un organisme auquel se fixe prioritairement une entité modifiant son comportement, tel qu'un ligand endogène, un médicament ou une drogue. Un exemple de cible thérapeutique courante sont les protéines et les acides nucléiques. La définition dépend du contexte et peut référer à la cible d'un médicament, la cible d'une hormone (comme l'insuline), ou la cible de stimulus externe. Le principe est que la cible est "touchée" par un signal et qu'ainsi sa fonction et son attitude sont changées.
Macrocycles are an attractive class of molecules due to their good binding properties and yet rather small size that allows, in many cases, crossing membranes to reach intracellular targets. In comparison to classical small molecule drugs, macrocycles are ...
Protein-protein interactions (PPIs) play important roles in many diseases and their modulation is an attractive strategy for developing new therapeutics. However, the relatively large and often flat binding surfaces of PPIs makes the development of inhibit ...
EPFL2022
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Developments in computational omics technologies have provided new means to access the hidden diversity of natural products, unearthing new potential for drug discovery. In parallel, artificial intelligence approaches such as machine learning have led to e ...