En chimie organique, l'adjectif « primaire » est utilisé pour classer certains types de composés (alcools, amines, amides, halogénure d'alkyle, etc.) ou intermédiaires réactionnels (radicaux alkyle, carbocations, etc.). Il désigne le des atomes d'hydrogène lié à l'atome central (carbone, azote, phosphore, etc.) de la fonction en question, par des groupes organyles, et en l'occurrence le fait qu'un seul atome d'hydrogène a été remplacé par un groupe organyle.
Par exemple, l'atome central d'un groupe alcool est l'atome de carbone, lié à un groupe hydroxyle ; l'alcool sera qualifié de « primaire » si l'atome de carbone est lui-même primaire, c'est-à-dire qu'outre le groupe hydroxyle, il est un lié à un seul groupe organyle, et deux atomes d'hydrogène. S'il est lié à deux groupes organyles et un atome d'hydrogène, il sera qualifié de « secondaire », et s'il est lié à trois groupes organyles, il sera qualifié de « tertiaire ». De même, une amine sera qualifié de « primaire » si son atome central, l'atome d'azote, est primaire (lié à un seul groupe organyle), et une phosphine sera qualifié de « primaire » si son atome central, l'atome de phosphore, est primaire.