Résumé
Le virus du Nil occidental (en West Nile virus) est l'agent infectieux qui, chez l'humain, provoque la fièvre du Nil occidental. C'est un virus à ARN monocaténaire de polarité positive (groupe de la classification Baltimore) appartenant à la famille des Flaviviridae et au genre Flavivirus, qui comprend également le virus de la fièvre jaune, le virus de la dengue, le virus Zika et le virus de l'encéphalite japonaise. Il est présent à la fois dans les régions tropicales et les zones tempérées. Il est transmis par la piqûre de moustiques, notamment ceux du genre Culex. Les oiseaux forment son réservoir naturel, de sorte que ce virus circule normalement entre les oiseaux et les moustiques. Comme les autres flavivirus, le virus du Nil occidental est un virus enveloppé à symétrie icosaédrique. La cryomicroscopie électronique a révélé des virions de recouverts d'une capside protéique relativement lisse, structure semblable à celle du virus de la dengue. La coque protéique est constituée de deux protéines structurales : la glycoprotéine E et la petite protéine membranaire M. La protéine E a plusieurs fonctions, notamment celle de liaison au récepteur de l'hôte, d'attachement du virus et d'entrée dans la cellule par fusion de l'enveloppe virale avec la membrane plasmique de l'hôte. L'enveloppe virale est une bicouche lipidique dérivée de la membrane cellulaire de l'hôte. La membrane lipidique des flavivirus contient du cholestérol et de la phosphatidylsérine, mais d'autres constituants restent encore à identifier. La membrane lipidique joue plusieurs rôles dans l'infection virale, notamment celui de signalisation lipidique favorisant l'entrée dans la cellule hôte, ce qui est notamment le cas du cholestérol. Les deux protéines d'enveloppe E et M sont insérées dans la membrane du virus. L'ARN du génome est lié aux protéines de capside C, longues de d'acides aminés, pour former la nucléocapside. Les protéines de capside sont parmi les premières produites dans une cellule infectée.
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