vignette|L'étang du village de en Allemagne, un exemple d'eau stagnante équilibré, favorable à la biodiversité et dont la végétation joue son rôle en matière de phytoépuration. Ce type d'eau stagnante saine, rafraîchissante l'été et possédant un aspect ornemental est perçu positivement par les riverains. vignette|Un homme buvant l'eau stagnante d'un réservoir de Oum Hadjer au Tchad. L'absence d'équilibre et de phytoépuration de ce type d'eau stagnante peut conduire à des problèmes de santé et à la prolifération de moustiques, vecteurs d'agents pathogènes. Les eaux stagnantes ou eaux dormantes sont, en écologie et en hydrologie, des étendues d'eau douce ou salée fermées où l'eau ne circule pas ou très peu. Ce terme est utilisé en opposition avec l'expression eaux courantes et peut désigner les mares et les étangs, très riches en biodiversité, mais également les flaques, trous d'eau, chenaux ou petits bras morts fermés, et plus rarement certains lacs ou marais avec une eau libre mais ayant un débit très lent. L'eau stagnante peut aussi être contenue dans un réservoir, un puits ou d'autres aménagements humains dans lesquels aucun équilibre biologique ne peut s'installer ou qui peut être polluée par de la matière organique. Dans ce cas l'eau stagnante peut être sujette à des processus de décomposition anaérobie (eau croupie) ce qui peut constituer un problème de santé publique. De même l'absence d'équilibre biologique et de prédateurs peut amener à la prolifération des moustiques pouvant transmettre des zoonoses à l'homme. La mise en place d'un plan de gestion restauratoire a pour but de corriger le problème. Certaines eaux stagnantes, moins oxygénées (et souvent plus chaudes que les eaux courantes, dans le même contexte) sont plus susceptibles d'abriter des vecteurs de zoonoses (tels que les moustiques piqueurs) et de maladies hydriques. Ce type d'eau stagnante peut être une source de risque sanitaire majeure. Ces eaux stagnantes peuvent aussi être contaminées par des excréments humains et animaux, en particulier dans les déserts ou dans d'autres zones de faibles précipitations.

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