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Concept
Test diagnostique du SARS-CoV-2
Résumé
Un test diagnostique du SARS-CoV-2 peut être effectué en cas de suspicion de maladie à coronavirus 2019 (Covid-19) à l'examen clinique et en complément à des examens approfondis (tomodensitométrie, etc.). Il peut être effectué par des tests de réaction en chaîne par polymérase après transcriptase inverse pour la détection de l'ARN viral (RT-PCR, pour « reverse transcription - polymerase chain reaction ») ou par des tests à base d'anticorps ELISA pour la détection des protéines du virion.
L'infrastructure de recherche européenne EVA (European Virus Archive) s'est rapidement organisée pour fournir aux laboratoires de diagnostic du monde entier des éléments viraux destinés à servir de contrôle pour les tests fondés sur l'ARN ou sur la protéine.
La méthode PCR - l’amplification en chaîne par polymérase (ACP), ou réaction de polymérisation en chaîne reverse transcription - polymerase chain reaction (ou PCR en anglais) - est une méthode de biologie moléculaire d'amplification génique in vitro.
Cette méthode PCR est inventée, en 1983, par Kary Mullis alors chercheur dans la synthèse des oligonucléotides au sein de Cetus Corporation, petite entreprise de biotechnologies californienne.
Officiellement reconnu comme père de la PCR, il reçoit en 1993, à , le prix Nobel de chimie, « pour sa contribution au développement des méthodes pour la chimie de l'ADN et pour son invention de la PCR ».
Au début des années 1990 la PCR évolue avec l'invention de la PCR en temps réel par Russell Higuchi et de la Q-PCR (Quantitative polymerase chain reaction) qui permet de réaliser des mesures quantitatives.
L'un des premiers tests par RT-PCR, est développé à La Charité à Berlin en en utilisant la PCR quantitative et a formé la base de que l'OMS distribue. Le , l'OMS diffuse un protocole-type établi par l'institut Pasteur de Paris. D'après une étude coréenne, ce dernier test aurait une sensibilité inférieure à la détection du gène N.
La sensibilité de ce type de test est évaluée de 50 à 60 % et la spécificité est assez mauvaise à 75 %, contre 99 % et 98 % pour les tests PCR multiplex, qui ne sont pas encore utilisés au début du mois de .
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