Joseph Emanuel Fischer von Erlach (baptisé le à Vienne, mort le dans la même ville) est un architecte autrichien baroque.
Second fils de l'architecte Johann Bernhard Fischer von Erlach, il développe son talent dans son atelier. En 1711, il dessine les projets de son père (comme le Palais Lobkowitz, le Palais Trautson, la , le ) et l'aide dans la rédaction d'un Plan d'une architecture historique en quatre volumes. Il apprend ainsi l'architecture classique et moderne.
Il reçoit l'instruction de Gottfried Wilhelm Leibniz, qui travaille avec son père jusqu'en 1714. Les deux obtiennent une bourse de Charles VI du Saint-Empire pour lui financer un voyage d'étude. En 1713 et 1714, il va en Italie et fait la connaissance de l'archéologue Francesco de Ficoroni. Entre 1717 et 1719, il est en France et rencontre le maître d'œuvre Robert de Cotte, l'architecte Germain Boffrand et le philologue Bernard de Montfaucon. De même, il est présent à Londres et à Leyde, où il découvre les nouvelles machines à vapeur et rencontre aussi Isaac Newton. L'ingénieur l'accompagne lors de son retour en Autriche.
Il revient à Vienne en 1722 et est fait architecte de la cour. Après la mort de son père en 1723, Lukas von Hildebrandt devient le premier architecte ; en 1725, grâce à l'appui de son puissant mécène , Joseph Emanuel récupère les travaux de son père pour les terminer comme l'église Saint-Charles-Borromée, la Hofbibliothek et la . Dans le cadre de son travail, il se consacre de plus en plus à mettre au point des machines à vapeur.
En 1727, il épouse Anna von Dietrich qui lui donnera quatre enfants. Il monte une importante collection d'art et une bibliothèque. Sa femme meurt en 1740 et lui en 1742 après une forte fièvre. Il laisse une grande fortune de florins.
Après sa mort, ses plans de la Michaelerplatz sont réalisés entre 1889 et 1893 par Ferdinand Kirschner qui les modifie pour intégrer le Burgtheater. De même, d'après ses plans, Georg Christian Unger réalise l'Alte Bibliothek de Berlin entre 1775 et 1780.