Zotero est un logiciel de gestion de références gratuit, libre et open source qui s'inscrit dans la philosophie du Web 2.0. Il permet de gérer des données bibliographiques et des documents de recherche (tels que des fichiers PDF, ). Ses principaux atouts reposent sur l'intégration au navigateur web ; la possibilité de synchronisation des données depuis plusieurs ordinateurs ; la génération de citations (notes et bibliographies) pour les utilisateurs des logiciels LibreOffice, Microsoft Word, NeoOffice, Zoho Books et OpenOffice.org Writer grâce à l’installation d'un plugin. Le développement du logiciel est à l'initiative du Center for History and New Media (CHNM) de l'université George-Mason située dans la banlieue de Washington en Virginie (États-Unis).
Le projet Zotero digital research platform est initié en 2005 par Dan Cohen, maître de conférence au CHNM de l'université américaine George Mason (GMU). Dès 2006, il est rejoint par Sean Takats dans le cadre d'un contrat de recherche post-doctoral. À partir de 2008, Takats et Cohen codirigent le projet avant que ce dernier ne devienne directeur du projet Digital Public Library of America.
Le terme « Zotero » dérive du verbe albanais « zotëroj » qui signifie « s'exercer », dans le sens de « acquérir des compétences par l'exercice ».
La première version de Zotero – 1.0.0b2.r1 – est mise à la disposition du public sous la forme d'une extension pour le navigateur Mozilla Firefox le . Avec pour objectif de rassembler une communauté d'utilisateurs, de répondre à leurs attentes et de promouvoir la diffusion du logiciel, le blog du projet est inauguré le . Parallèlement, ses animateurs lancent un appel à candidature et recherchent un développeur et un Évangéliste technologique à plein temps pour soutenir le développement.
Dès le , la version 1.0.0b2.r2 de Zotero accompagne la version finale 2.0 de Firefox. Le lendemain, Sean lance un appel via le blog afin de traduire le logiciel à l'aide de BabelZilla.
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Couvre les bases de l'utilisation de Zotero, un logiciel de gestion de référence gratuit et open-source avec des fonctionnalités telles que l'intégration de navigateur Web et la synchronisation en ligne.