Les microchiroptères (Microchiroptera) constituaient un sous-ordre des chiroptères (ou chauves-souris) jusqu'aux révisions systématiques du début des années 2000 à l'aide d'outils génétiques. On les appelait également « chauves-souris insectivores », « chauves-souris utilisant l'écholocation », « petites chauves-souris » ou « vraies chauves-souris ». Tous ces noms sont cependant inadaptés car tous les microchiroptères ne sont pas insectivores et certains sont plus gros que les plus petits mégachiroptères. Surtout, la systématique de l'Ordre des Chiroptères a été revue et corrigée à l'aide de données moléculaires. Les sous-ordres Microchiroptera et Megachiroptera ont laissé la place aux sous-ordres Yinpterochiroptera (Mégachiroptères + quelques familles de Microchiroptères) et les Yangochiroptera (les familles de Microchiroptères restantes).
Cette classification est cependant très récente (les années 2000) et n'est pas encore rentrée dans les mœurs.
Les caractères distinctifs des microchiroptères par rapport aux mégachiroptères sont :
Les microchiroptères utilisent intensivement l'écholocation, contrairement aux mégachiroptères.
Les microchiroptères n'ont pas de griffes à l'index des pattes antérieures.
Les oreilles des microchiroptères ne forment pas un anneau fermé : les bords sont séparés l'un de l'autre à la base de l'oreille.
Les microchiroptères n'ont pas de sous-poil : ils n'ont que des poils épais ou sont glabres.
La plupart des microchiroptères sont insectivores. Certaines des espèces les plus grandes chassent des oiseaux, des lézards, des grenouilles et même des poissons. Il existe, en Amérique du Sud des microchiroptères qui se nourrissent du sang des grands mammifères, appelés chauves-souris vampires. Les microchiroptères mesurent entre 4 et 16 cm de longueur.
Les chauves-souris sont les exemples les plus connus d'animaux utilisant l'écholocation. Tous les microchiroptères l'utilisent. Le seul mégachiroptère connu à l'utiliser est du genre roussette (Rousettus), bien que son système d'écholocation soit différent de celui des microchiroptères.
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Les Chiroptères (Chiroptera), appelés couramment chauves-souris (ou chauvesouris), sont un ordre de mammifères placentaires comptant près de , soit un cinquième de près de de mammifères connues ; avec regroupés en . C'est le groupe de mammifères le plus important après celui des rongeurs. Ces animaux nocturnes volants sont souvent capables d'écholocation (capacité surtout développée chez les microchiroptères insectivores ; essentiellement actifs la nuit, ils se dirigent dans l'obscurité en émettant des ultrasons dont ils captent la réflexion, écholocalisant ainsi leurs proies et les obstacles.
Horseshoe bats are bats in the family Rhinolophidae. In addition to the single living genus, Rhinolophus, which has about 106 species, the extinct genus Palaeonycteris has been recognized. Horseshoe bats are closely related to the Old World leaf-nosed bats, family Hipposideridae, which have sometimes been included in Rhinolophidae. The horseshoe bats are divided into six subgenera and many species groups.
La famille des Pteropodidae regroupe des chauves-souris dont le nom vernaculaire utilise le terme de roussette, mais pas uniquement. Jusqu'à récemment, elles formaient la seule famille du sous-ordre des Mégachiroptères (Megachiroptera). Cependant, des études moléculaires ont bouleversé la classification des Chiroptères et les Pteropodidae sont désormais regroupés avec quelques familles de Microchiroptera au sein des Yinpterochiroptera. Cette famille compte près de 191 espèces réparties dans 46 genres.