Amplicon

Résumé

vignette| Un modèle de séquence d'amplicon qui a été préparé pour l'amplification. La séquence cible à amplifier est colorée en vert. En biologie moléculaire, un amplicon est un morceau d'ADN ou d'ARN qui est la source et/ou le produit d'événements d'amplification ou de réplication. Il peut être formé artificiellement, en utilisant diverses méthodes, notamment les réactions en chaîne par polymérase (PCR) ou les réactions en chaîne par ligase (LCR), ou naturellement par duplication de gènes. Dans ce contexte, l'amplification fait référence à la production d'une ou plusieurs copies d'un fragment génétique ou d'une séquence cible, en particulier l'amplicon. Comme il fait référence au produit d'une réaction d'amplification, l'amplicon est utilisé de manière interchangeable avec des termes de laboratoire courants, tels que « produit de PCR ». L'amplification artificielle est utilisée dans la recherche, la médecine légale, et la médecine à des fins qui incluent la détection et la quantification des agents infectieux, l'identification des restes humains, et l'extraction des génotypes des cheveux humains. La duplication naturelle des gènes joue un rôle majeur dans l'évolution. Il est également impliqué dans plusieurs formes de cancer humain, notamment le lymphome médiastinal primitif à cellules B et le lymphome de Hodgkin. Dans ce contexte, le terme amplicon peut désigner à la fois une section d'ADN chromosomique qui a été excisée, amplifiée et réinsérée ailleurs dans le génome, et un fragment d'ADN extrachromosomique appelé double minute, chacun pouvant être composé d'un ou plusieurs gènes. L'amplification des gènes codés par ces amplicons augmente généralement la transcription de ces gènes et finalement le volume des protéines associées. Les amplicons sont en général des séquences génétiques répétées directes (tête-à-queue) ou répétées inversées (tête-à-tête ou queue-à-queue), et peuvent être de structure linéaire ou circulaire. Les amplicons circulaires consistent en des duplications inversées imparfaites recuites dans un cercle et on pense qu'ils proviennent d'amplicons linéaires précurseurs.

Source officielle

https://fr.wikipedia.org/wiki/Amplicon

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Séquençage de l'ADN

cadre|Résultat du séquençage par la méthode de Sanger. L'ordre de chaque bande indique la position d'un nucléotide A,T,C ou G Le séquençage de l'ADN consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné. La séquence d’ADN contient l’information nécessaire aux êtres vivants pour survivre et se reproduire. Déterminer cette séquence est donc utile aussi bien pour les recherches visant à savoir comment vivent les organismes que pour des sujets appliqués.

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