Analyse de la communauté microbienne : méthodes et applications

Cette séance de cours porte sur les méthodes utilisées en écologie microbienne pour analyser les communautés microbiennes, y compris les techniques indépendantes de la culture et de la culture. Il traite de l'application de l'hybridation in situ de fluorescence (FISH) pour la visualisation d'espèces microbiennes spécifiques, des analyses génétiques utilisant la PCR et de l'utilisation d'isotopes stables pour étudier les transformations microbiennes. La séance de cours explore également des techniques comme les microcapteurs, la cytométrie en flux et la génomique à cellules uniques pour relier les fonctions microbiennes à des cellules individuelles. Diverses études de cas et exemples sont présentés pour illustrer les applications pratiques de ces méthodes dans l'étude des activités microbiennes dans la nature.