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Cette séance de cours présente la biologie des systèmes, en mettant l'accent sur la vision holistique des processus biologiques et l'utilisation de modèles informatiques et mathématiques pour étudier des systèmes biologiques complexes. Il aborde des sujets tels que les voies métaboliques, les modèles métaboliques à l'échelle du génome, l'annotation fonctionnelle du génome et la reconstruction semi-automatisée des modèles métaboliques à l'échelle du génome. La séance de cours traite également de l'application des GEM, y compris l'analyse de l'équilibre de flux (FBA) et dans les études de l'essentielité du gène silico. En outre, il explore les défis à relever pour combler les lacunes de connaissances dans le métabolisme, comme les fonctions géniques inconnues et la promiscuité enzymatique, et présente des outils comme BNICE.ch pour la biochimie prédictive. La séance de cours se termine par le potentiel de la biologie des systèmes et de l'ingénierie métabolique en bioproduction.
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