Analyse microbienne de la communauté : méthodes et techniques

Cette séance de cours porte sur les méthodes et les techniques utilisées pour analyser les communautés microbiennes, y compris les approches qui dépendent de la culture et qui sont indépendantes de la culture. Il traite de la microbiologie de culture d'enrichissement, des procédures classiques d'isolement des microbes, des méthodes sélectives d'isolement unicellulaire et de l'utilisation d'hybridation in situ de fluorescence. La séance de cours explore également le concept de biais d'enrichissement, les techniques de dilution à extinction et l'application de la cytométrie en flux dans l'analyse microbienne. De plus, il s'inscrit dans les principes des méthodes de coloration, de coloration de viabilité et de l'utilisation de sondes d'acide nucléique pour l'hybridation in situ de fluorescence. La séance de cours se termine par une discussion sur les méthodes moléculaires telles que l'hybridation pour l'étude des communautés microbiennes.