Simulations de dynamique moléculaire classique

Cette séance de cours présente les champs de force classiques et les simulations de dynamique moléculaire, en se concentrant sur la propagation des positions atomiques dans le temps. Il couvre le programme ToyMD, la dynamique moléculaire du gaz CO2 et l'approximation classique pour décrire les propriétés supramoléculaires. Les sujets abordés comprennent les interactions intramoléculaires et intermoléculaires, le champ de force atomique et l'échantillonnage d'ensembles spécifiques. La séance de cours traite également du potentiel de Lennard-Jones, du paramétrage du champ de force et de la fonction de distribution radiale de la paire. Les exercices pratiques consistent à exécuter des simulations MD dans l'ensemble NVT, à étudier les champs de force et à visualiser les fonctions de distribution radiale.