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Explore les mouvements de Monte Carlo en simulation, y compris les mouvements d'essai et les mouvements biaisés, en comparant Monte Carlo avec la dynamique moléculaire.
Couvre la théorie et les applications pratiques des simulations de pliage de protéines en utilisant la dynamique moléculaire, en se concentrant sur les effets des solvants et l'analyse de la dynamique de pliage.
Explore l'évolution des simulations biomoléculaires, en mettant l'accent sur des modèles précis, l'augmentation de l'échantillonnage et le rôle transformateur des simulations dans la prédiction des résultats expérimentaux.
Explore l'échantillonnage de l'ensemble canonique, les fluctuations de température, le contrôle lagrangien étendu et la dynamique moléculaire de la température.
Explore les surfaces d'énergie potentielles dans les simulations de dynamique moléculaire et l'utilisation de méthodes mécaniques quantiques / moléculaires mixtes.
Explore la dynamique efficace pour les équations différentielles stochastiques non réversibles, couvrant la dynamique moléculaire, les goulets d'étranglement, la graine grossière et la connexion à l'énergie libre.
