Germline mutations in retinoma patients: Relevance to low-penetrance and low-expressivity molecular basis
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2009 journal articles
Résumé
Purpose: To study phenotype-genotype correlation in patients who have retinoma, which is a benign tumor resembling the post irradiation regression pattern of retinoblastoma (RB).
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Une étude d'association pangénomique (en anglais genome-wide association study, GWAS) est une analyse de nombreuses variations génétiques chez de nombreux individus, afin d'étudier leurs corrélations avec des traits phénotypiques. Ces études se concentrent généralement sur les associations entre les polymorphismes nucléotidiques (SNP) et des phénotypes tels que les maladies humaines majeures. En effet, quand elle est appliquée sur des données humaines, une comparaison de séquences d’ADN se fait entre individus ayant plusieurs phénotypes différents pour un même caractère, la taille par exemple.
L'héritabilité mesure la part de variabilité d'un trait phénotypique qui dans une population donnée, est due aux différences génétiques entre les individus composant cette population. L'héritabilité au sens large est égale à la variance du trait attribuable aux différences génétiques dans la population divisée par la variance totale du trait dans la population. L'héritabilité au sens étroit correspond à une partie de l'héritabilité au sens large, ne tenant compte que de la variance d'origine génétique dite additive.
vignette|Schéma illustrant le phénomène de pénétrance : même avec un génotype Cc identique, les enfants de la génération F1 n'expriment pas tous le même phénotype (représentés en blanc et en orange) La pénétrance, en génétique, est la portion d'individus possédant un génotype donné qui exprime le phénotype correspondant . La pénétrance varie selon l'âge, . Elle est à différencier de l'expressivité qui définit le degré de l'expression d'un phénotype (son intensité) chez l'individu possédant le génotype correspondant.
Lung cancer is the leading cause of cancer-related deaths worldwide and the most common
lung cancer subtype is lung adenocarcinoma (LUAD). Frequently mutated genes involve
activating mutations in KRAS and loss of function mutations in TP53. LUADs primarily ...
Background: Cancer genome sequencing enables accurate classification of tumours and tumour subtypes. However, prediction performance is still limited using exome-only sequencing and for tumour types with low somatic mutation burden such as many paediatri ...
The resilience of the mitochondrial genome (mtDNA) to a high mutational pressure depends, in part, on negative purifying selection in the germline. A paradigm in the field has been that such selection, at least in part, takes place in primordial germ cells ...
